關於玄女的職能，也是壹個值得探討的問題。嚴可均《全上古三代秦漢三國六朝文．全上古三代文》卷十六稱：“玄女未詳，或雲天帝女，壹雲即西王母。”李幹忱《破除迷信全書》稱：“據傳這是上古的龍女。”孫紹先先生認為玄女即上古天神，玄女形象為人首鳥身，與天神的職司性質相合，玄鳥很有可能就是玄女的變體形象之壹；玄女、女媧、西王母可能是“三位壹體”的天神變異現象；玄女主兵殺之職，授黃帝兵信神符，制服蚩尤，只能理解為天神的權威之壹。周曉薇認為，玄女乃是我國古代傳說中的司兵女神。胡萬川稱玄女是掌劫大神、兵法天書的傳授者、英雄人物危機的救助者、以及英雄未來前途的指引者。壹些宗教學方面的著作提到，玄女還是常與素女並稱“玄素”的講房中術的女仙。
以上諸說對理解玄女的職能有重要的參考價值，但也有偏頗，主要是論者未能充分利用漢代特別的魏晉以來有關玄女的大量傳世文獻。筆者通過對這些文獻的考察認為，在宋代以前，玄女的職能主要有： 如果我們承認玄女來源於上古女性生殖崇拜，那麽在玄女的諸多職能中，其身份首先為房中術神。房中術與性崇拜的目的盡管有所不同，前者在於養生、延壽乃至成仙，後者在於種族之蕃衍昌盛，但兩者在性神秘方面卻有著內在的聯系，都是通過男女交媾來達到目的。
最早記載房中術玄女神的文獻始於漢代，托名劉向成書於東漢的《列仙傳》卷下《女幾》載：
女幾者，陳市上酤酒婦人也。遇仙人過其家飲酒，以《素書》五卷為質，幾開視其書，乃養性交接之術。行文書之法，如此三十年，顏色更如二十，遂棄家追仙人去，莫知所之。雲：玄素有要，近取諸身；彭聃得之，五卷以陳。女幾蘊妙，仙客來臻。傾書開引，雙飛絕塵。
上引文中的“玄素”，既是房中術神玄女和素女的合稱，又是房中術經典《玄女經》和《素女經》的合稱，甚至常常又是房中術的代稱。由上可知，在漢代，房中術之壹的玄素之道已被視為成仙得道之術，女幾因掌握該術而得以絕塵飛升。
房中術為道教的方術之壹，玄女作為房中術神依然居於主要地位。據葛洪《神仙傳》卷四《張道陵》載：張道陵“其治病事皆采取玄素”。魏晉時期，房中術更加盛行，“房中之法十余家”，“玄素、子都、容成公、彭祖之屬”而“玄素”列其首，房中經有《玄女經》《素女經》《彭祖經》《陳赦經》《子都經》《天門子經》《容成經》，而《玄女經》位居第壹。葛洪的神仙道教以房中為長生成仙之道，據其所載，確有人因修煉玄素之道而長壽或成仙。
容成公者，行玄素之道，年二百歲。（《神仙傳》卷七《容成公》）
甘始者，行房中之事依容成玄素之法，在世百余歲，乃入王屋山仙去也。（《神仙傳》卷十《甘始》）
昔黃帝，論道養則資玄素二女，故能畢該秘要，窮道盡真，遂升龍以高躋，與天地乎罔極也。（《抱撲子內篇．極言》）
上引《列仙傳》中的女幾似乎也由是而得道成仙了。 《玄女經》在《隋書．經籍誌》醫方類中尚有著錄：《素女秘道經》壹卷並《玄女經》，但在以後的中國史誌中未見記載，似已亡佚，幸賴日本人丹波康賴撰於永觀二年（984）的《醫心方》才得以保存或部分保存。《醫心方》以養生為主，介紹了中國傳統醫學，***三十卷，卷第廿八《房內》為中國古代房中術著作之輯錄，分為三十篇，明確為《玄女經》的或與玄女有關的有《至理第壹》《和誌第四》的壹部分，《四至第十》《九氣第十壹》《九法第十二》的全部。據《醫心方》可知，《玄女經》不僅具體地介紹了房中術的方法，而且還有與中國哲學精神壹致的房中理論：
《玄女經》雲：黃帝問玄女曰：“吾受素女陰陽之術，自有法矣。願復命之，以悉其道。玄女曰：“天地之間，動須陰陽。陽得陰而化，陰得陽而通。壹陰壹陽，相須而行。故男感堅強，女動辟張，二氣交精，流液相通。能知其道，樂而且強，壽即增延，色如華英。”（《至理第壹》）
通過以上文獻，我們可以明確：漢魏時期，玄女在社會上特別是道教之中有很大影響。玄女與素女是房中術的老前輩，彭祖、老聃是她們的學生，黃帝的飛升也有賴於她們的法術，而在玄素之中，玄女又居於首位。這些都說明了在玄女房中術方面的神聖地位。 玄女作為指導黃帝戰勝蚩尤的戰爭女神，其根據主要為本文前引《龍魚河圖》《黃帝問玄女兵法》等有關文獻。此外，還有《繹史》卷五所引《黃帝內傳》稱：
黃帝伐蚩尤，玄女為帝制夔牛鼓八十面，壹震五百裏，連震三千八百裏。
玄女在此似乎又成了黃帝的軍需官。但不管如何，玄女具有戰神的職能是沒有疑問的。 關於玄女的戰神職能，筆者以為很可能源自壹種附會。黃帝戰蚩尤神話由來已久，先秦文獻中多有記述，而明確玄女參與其事的最早文獻卻是漢代緯書《龍魚河圖》。也就是說，玄女此前本與黃帝戰蚩尤神話無關，此時卻突然成為這場傳頌已久的聖戰中舉足輕重甚至扭轉乾坤的角色。《龍魚河圖》固然有聲有色地描畫了玄女的神威，但作為緯書，論者對其常持懷疑態度：
到了漢人偽造《龍魚河圖》，更神乎其神地說“黃帝攝政”由《漢書．王莽傳》及新莽量刻辭看，王莽自稱是黃帝之後。當莽居攝時，有翟方進亂，討之；認為《龍魚河圖》所傳說黃帝伏蚩尤事，正隱射王莽討翟方進之戰，所以將漢代所通用的武器“刀戟大弩”也搬到史前時代黃帝伐蚩尤的戰場上去。大體說來，古籍中所傳壹切的史前神話，都會攙雜著書者時代器用及背景。
由此推測，此時被附會上去的玄女，既然可以代表天命來支持王莽自認的祖先——黃帝，應原本即已有相當實力，是早就享有盛名的壹位女神。而其盛名之取得，與之作為房中術神不無關系。《漢書．藝文誌》稱：“房中者，情性之極，至道之際，樂和有節，則和平壽考。”漢代方士以房中合氣求長生不老，巫覡則在民間行房中術療病去疾，作為高級養生之道為時尚所推崇。《漢書．藝文誌》房中類所錄八家（僅存書目）中，從書目看雖未見與玄女有關者，但玄女在房中各家中具有悠久的歷史，有的學者根據《列仙傳．女幾》推測：《玄女經》是西漢時就有的古書。我們從前引《列仙傳．女幾》以及《論衡》中確可看出，房中術玄女的影響力很大。在這種情況下，本來就是黃帝之師（房中術方面）的玄女，被拉大旗作虎皮，改造為政治神話中的重要角色（增加了壹項新職能），為王莽的政治鬥爭服務，是不足為怪的。從而使玄女也走過了房中術神——社會影響日益增大——最終被附會為戰神這樣壹個歷程。 煉丹興起於戰國時代，時人視為長生不老之術。道教產生後，外丹黃白術又成為道教的重要方術。玄女作為丹藥神至少在魏晉時期已很有名氣，《抱樸子內篇》就有記載：
合此金液九丹，皆當祭，祭則太乙元君、老君、玄女皆來鑒省。（《金丹》）
凡作黃白，皆立太乙、玄女、老子坐醮祭，如作九丹法，常燒五香，香不絕。（《黃白》）
此處所載，道士煉丹時需要祀神，玄女等神皆來視察監督，其為煉丹時的佑護神無疑。結合《抱撲子內篇》以“還丹金液”為“仙道之極”、“九丹誠為仙藥之上法”，（《金丹》）以及“仙藥之上者丹砂，次則黃金，次則白銀”（《仙藥》）等說法，可知玄女在丹藥領域中具有重要地位。
道教中還流行著玄女授黃帝以丹經的說法。唐人王瓘撰《廣黃帝本行紀》稱：
黃帝，登稽山，陟王屋，開石函，發玉笈，得金鼎九丹之經，復受九轉之訣於玄女。
成書於晉以前的《黃帝九鼎神丹經》所載更為詳盡：
黃帝受還丹至道於玄女。玄女者，天女也。黃帝合而服之，遂以登仙。玄女告黃帝曰：“凡欲長生而不得神丹金液，徒自苦也。雖呼吸導引吐故納新及服草木之藥，可得延年，不免於死也。服神丹，令人神仙度世，與天地相畢，與日月同光，”
此處玄女提出的丹藥理論與《抱撲子內篇》推崇丹砂等金石礦物為升仙上藥的說法是壹致的。 據洪邁《夷堅誌》補卷第十二《赤松觀丹》，玄女還親自煉過丹藥，後世在其煉丹處建立了宮觀。婺州金華赤松觀，相傳為九天玄女煉丹之所。雲丹始成時，凡三粒，以壹祭天，壹祭地，皆瘞於隱所，壹以自餌。蓋不知幾何世矣！
《夷堅誌》為宋代作品，所記當為當時流行已久的傳說。同書乙誌卷第七《畢令女》還記載了玄女傳授“道家所謂回骸起死”之“秘術”的傳說。看來，玄女不僅能使生人長壽成仙，亦可使死人起死回生。
另外，值得註意的是，在道教煉丹術中，玄女還是丹藥的主要成分——汞（水銀）的隱名。《魏伯陽七返丹砂訣》（黃童君註解）謂：天生玄女（水銀，位於太陰，故曰玄女），地出黃男（硫黃），皆稟靈氣。煉丹砂成水銀，再煉水銀復成丹砂，變煉七轉，即可通靈，謂之七返靈砂。
以上記載表明，玄女不僅為丹藥之佑護神，且有壹套丹藥理論，並親自煉過丹，甚至還成了丹藥原料的隱名。因此，玄女確是壹位丹藥之神。 “術”是方術，“數”指氣數，術數就是用各種方術觀察自然界的各種變化，來推測人和國家的氣數與命運，是古代的預測學。術數起源於原始宗教文化，後發展為道教占驗術，主要有：圖讖、占星、擇日禁忌、望氣、風角、易占、太乙神術、六壬、奇門遁甲等。道教術數典籍《黃帝龍首經》序有“黃帝將上天，次。召其三子而告之曰：‘吾昔受此《龍首經》於玄女’”之謂，而《抱樸子內篇》即已著錄《龍首經》壹書，據此，可知最遲在東晉時期，玄女就已具備了術數神的職能。
有關術數神玄女，歷史上曾產生過大量文獻，現僅錄史誌中明確標有玄女之名的此類圖書書目如下：
《隋書．經籍誌》：《玄女式經要法》壹卷
《舊唐書．經籍誌》：《玄女彈五音法相冢經》壹卷胡君撰
《新唐書．藝文誌》：《玄女式經要訣》壹卷 胡君《玄女彈五音法相冢經》壹卷
《宋史．藝文誌》：《占風九天玄女經》壹卷 《玄女金石玄悟術》三卷 《玄女玉函龜經》三卷 《玄女五兆筮經》五卷
袁天綱壹作“孫思邈”《九天玄女墜金法》壹卷 《玄女三廉射覆經》壹卷 《玄女常手經》二卷 《玄女遁甲秘訣》壹卷 《玄女式鑒》壹卷
《玄女關格經》壹卷皆六壬占驗之訣 玉樞真人《玄女截壬課訣》壹卷 《玄女簡要清華經》三卷 《玄女墓龍冢山年月》壹卷 《玄女星羅寶圖訣》壹卷
《玄女十課》壹卷 《玄女斷卦訣》壹卷 《九天玄女訣》壹卷
以上圖書除《占風九天玄女經》列入“天文”類外，其余皆列入“五行”類。這些圖書至元明時已多亡佚,無法見其原貌，但通過保存於《道藏》中的《黃帝龍首經》（隋唐宋各代的史誌皆有著錄）和《黃帝授三子玄女經》，仍可窺其壹斑。
《黃帝龍首經》上下經各三十六占，法用六壬。分述七十二項占吉兇法，如占歲月利道吉兇，占嫁娶祠祀吉日等。其占法屬六壬遁甲壹類，以年月日之幹支及所值星宿相配，依其間陰陽之沖和生克，定人事之吉兇。《黃帝授三子玄女經》言視日辰吉兇之術，凡十四條（似有缺佚）。第壹條述與人期會吉日良辰；第二條言占求物法；第三條以下皆述娶婦嫁女之日辰。此外，保存在道教中的《九天玄女課》《玄女房中經》《九天玄女竈告秘法》等有關典籍，亦與玄女密切相關。這些都說明玄女具有術數神職能。
以上介紹了作為房中術神、戰神、丹藥神和術數神的玄女的大致情況。應該指出的是，根據有關文獻，我們可以進壹步認定，上述四種職能不同的玄女並非毫無關系的四位女神，而是身兼四任，其間有著不可分割的內在聯系：在《抱樸子內篇》中，玄女既是房中術神又是丹藥神。題為孫思邈所撰的《玄女房中經》，述房中宜忌日辰，表明了房中術神玄女和術數神玄女的密切關系。唐代兵書《太白陰經》卷十《雜式．玄女式》稱：“玄女式者，壹名六壬式，玄女所造，主北方萬物之始，因六甲之壬，故曰六壬。”體現了術數神玄女與戰神玄女的內在聯系。《雲笈七簽》卷壹百《軒轅本紀》載：“玄女教帝三官秘略五音權謀陰陽之術。玄女傳《陰符經》三百言，帝觀之，十旬討伏蚩尤。”是為戰神玄女所為，又載：“黃帝，於玄女、素女受房中之術，能禦三百女。玄女授帝如意神方即藏之崆峒山。”是為房中術玄女之所為。 此外，在房中術、戰爭、丹藥和術數四個方面，玄女皆為黃帝（被尊為中華民族的始祖，地位甚高）之師，此亦壹神四任之有力內證：
(1)黃帝“論道養則資玄素二女”，遂“與天地乎罔極”；
(2)“天遣玄女下授黃帝兵信神符，制服蚩尤。”
(3)“黃帝受還丹至道於玄女”，“遂以登仙”；
(4)黃帝“受《龍首經》於玄女”，並將此術數典籍傳之於世。因此可以確定，作為黃帝之師，玄女是壹位身兼數職的神通非凡的女神。