明代成化12年（1476年）和弘治四年（1491年），大儒陳白沙先後倡議興建大忠祠和慈元廟，前者為表彰"三忠"文天祥、陸秀夫和張世傑，後者為紀念以身殉國的宋少帝及楊太後。廟建成之後，陳白沙用自制的茅龍筆書寫《慈元廟碑》，弟子湛雨（後改名為湛若水）為之作跋。據說，崖山慈元廟等建築物於1943年為日寇所毀，僅存廢墟。幸《慈元廟碑》等碑石免遭劫難，才得以重新樹立。
書《慈元廟碑》的時候，陳白沙已經年過七十，而且是帶病的狀態，然而情之所至，他壹氣呵成，為後人留下書法瑰寶。
陳白沙認為宋朝滅亡的原因在於在自身的腐敗。北宋在國家昌盛的時候，君臣沒有精壹學問修身，也沒有以行政革新天下，有程顥兄弟這些賢能也不能盡其用。南宋時，國家更是缺乏誌向，日益積弱，最後還出現善惡不分、刑賞適當、百姓愈貧等情況，滅亡不可避免。
慈元廟碑（原文）
世道升降，人有任其責者，君臣是也。予少讀《宋史》，惜宋之君臣，當其盛時，無精壹學問以誠其身，無先王政教以新天下；化本不立，時措莫知，雖有程明道兄弟不見用於時。跡其所為，高不過漢唐之間。仰視三代以前，師傅壹尊而王業盛，畎畝既出而世道亨之，君臣何如也?南渡之後，惜其君非撥亂反正之主，雖有其臣，任之弗專，邪議得以間之。大誌弱而易撓，大義隱而弗彰，量敵玩仇，國計日非，往往坐失機會，卒不能成恢復之功。至於善惡不分，用舍倒置，刑賞失當，怨憤生禍，和議成而兵益衰，歲幣多而民愈困，如久病之人，氣息奄奄，以及度宗之世則不復惜，為之掩卷而涕，不忍復觀之矣。孔子曰："人之生也直，罔之生也幸而免。"劉文靖廣之以詩曰："王綱壹紊國風沈，人道方乖鬼境侵，生理本直宜細玩，蓍龜萬古在人心。"噫！斯言也。判善惡於壹言，決興亡於萬代，其天下國家治亂之符驗歟?宋室播遷，慈元殿草創於邑之崖山。宋亡之日，陸丞相負少帝赴水死矣。元師退，張太傅復至崖山，遇慈元後問帝所在，慟哭曰："吾忍死萬裏間關至此，正為趙氏壹塊肉耳，今無望矣。"投波而死，是可哀也！崖山近有大忠廟，以祀文相國、陸丞相、張太傅。弘治辛亥冬十月，今戶部侍郎，前廣東右布政華容劉公大廈行部至邑，與予泛舟崖門，吊慈元故址，始議立祠於大忠之上。邑著姓趙思仁請具土木，公許之。予贊其決，曰："祠成，當為公記之。"未幾，公去為都禦史，修理黃河，委其事府通判顧君叔龍。甲寅冬祠成。是役也，壹朝而集，制命不由於有司，所以立大閑，愧頹俗，而輔名教，人心之所不容已也。碑於祠中，使來者有所觀感。弘治己未夏，予病小愈，尚未堪筆硯，以有督府鄧先生之命，念慈元落落東山作祠之意，久未聞於天下，力疾書之，愧其不能工也。南海病夫陳憲章識。