從山下停車場沿中軸線石梯向上，第壹重殿宇是靈祖樓，為歇山式建築，供奉道教護法神王靈官，紅臉虬須朱發，三目怒視，金甲紅袍，綠靴風帶，左手掐靈官訣，右手執金鞭，足踏風火輪和祥雲。王靈官登真後由玉皇大帝封為“都天糾察豁落先天主將”，司天上、人間糾察之職，成為道教的護法主將。老百姓贊之曰：三眼能觀天下事，壹鞭驚醒世間人。旁塑四大天王，殿後供奉財神趙公明元帥。靈祖樓後有 64 級石梯，象征六十四卦，登完即達第二重大殿混元殿。
混元殿為單檐硬山式建築，殿中供奉手持混元乾坤圈的混元祖師，左右供奉太 陽帝 君、太陰皇君（日、月神）。混元祖師即太上老君，宋真宗尊太上老君為混元上德皇帝，所以被稱為混元祖師。混元乾坤圈與日月星君象征著無極而太極，太極動靜而生陰陽，陰陽而化生萬物。這意味著世界的本原處於混沌狀態，是混元祖師開天辟地。 混元殿後有陡峭的 36 級石梯，各梯有尺余，舉足高於手，名曰上天梯。 36 級石梯象征三十六天，是修仙由低向高的階梯，登上三十六天，寓意是到達了道教中飛升成仙的最高境界。三十六梯之上是老君山之顛的老君廟主殿三清殿。殿前有八卦亭，建於 1926 年，象征道教教理“天圓、地方、陰陽相生、八卦交配成萬化”，亭內供奉老君騎青牛的塑像，亭後即是三清殿。
三清殿建於 1931 年，為單檐硬山式建築，面闊八開間。殿內供奉每尊高約 4 米 的三清尊神。端坐於大殿中央蓮臺上的是玉清元始天尊，又稱天寶君。他頭罩神光，左手虛拈，右手虛捧，象征天地未形、萬物未生、清濁未判、陰陽未分、混沌之時的“無極”狀態，即宇宙形成的第壹大世紀。居住在清微天玉清境中，故稱玉清。在其左邊的是上清靈寶天尊，又稱靈寶君。他手持太極圖，象征混沌始辨、清濁剖判、陰陽初分的“太極”狀態，即宇宙形成的第二大世紀。居住在禹余天上清境，故稱上清。右邊的是太清道德天尊，即太上老君，又稱作神寶君。手搖太極神扇，俯視著世間的萬事萬物，象征宇宙形成的第三大世紀。居住在大赤天太清境中，故稱太清。《九天生神章經》說：“三號雖殊，本同壹也。”三清都是“道”的人格化與別名。兩廂塑有十二金仙。 三清殿左側是來鶴軒。傳說壹個皓月當空之夜， 7 位仙人駕白鶴翩翩飛到老君山，棲息在參天古柏枝頭，祥雲波湧。三清殿後七真殿供奉丘長春、馬丹陽、孫不二等 7 位真人，他們神情飄逸，瀟灑自如地乘坐於 7 只姿態不同的丹頂白羽的仙鶴上，正是這個傳說的體現。
七真殿對面是三元殿，供奉上元壹品天官賜福紫微帝君、中元二品地官赦罪青靈帝君、下元三品水官解厄 谷帝 君，分別隸屬玉清境、上清境、太清境。天官賜福，每逢 正月十五日 ，即下人間，校定人之罪福。地官赦罪，每逢 七月十五日 ，即來人間，校戒罪福，為人赦罪。水官解厄每逢 十月十五日 ，即來人間，校戒罪福，為人消災。張道陵創立天師道時，就已祭祀天、地、水三官，上三官手書作為道教徒請禱治病的方法。道教以 正月十五日 、 七月十五日 和 十月十五日 為天、地、水三官神誕之日。老君廟繼承了天師道傳統，在此期間都建金、黃道場，以祈福消災。三元殿上是鬥姥樓，為歇山式建築，供奉先天大梵鬥姥。鬥姥，又稱“鬥姆”，道教尊稱為“圓明道母天尊”，為北鬥眾星之母。 老君廟四周現有明、清古柏二百余株，枝葉參天，蒼勁巍峨，終年翠綠。遙望如書屏瑩立，日出時隱現於雲煙繚繞之間，晴天雲霧翻湧，雨天黛色空朦，故有“稠粳出雲”之美稱。每到老君廟小憩，就能體會到“分明指出神仙窟，頗覺心如太古時”的真實意境。
老君廟齋醮科儀在川西道觀中是比較有名的，遵循古法舉行，是傳統的宗教活動。
齋醮，俗稱法會，指供齋醮神，設壇祭禱神靈，是道教特有的宗教儀式。齋醮的目的是使人與神靈溝通，祈禱神靈保佑，賜福消災度厄。齋醮分“醮事”與“齋事”。“醮事”，稱陽法事，俗稱“祈福法事”，為善信所禱，如消災、解厄、安宅、報恩、還願、財亨、事業順等。“齋事”，稱陰法事，為各姓祖先、冤親債主及無祈孤魂普施煉度超拔，使信人七祖與眾魂悉永離三途五苦，十類四生即超陰境，信人得以清吉，永沐平安之福。老君廟在最近十幾年中所做的大型齋醮主要有： 1992 年 7 月建“水陸大齋”為期 12 天； 1993 年 7 月建“度人大齋”為期 12 天， 8 月響應中國道協號召，建“羅天大醮”（老君廟作為四川省南壇），歷時 12 天； 2004 年 農歷二月十五日 設壇慶太上聖壽萬盞明燈“水陸大醮”； 4 月，作為“中國（成都）道教文化節”分會場舉辦了“萬人法會”。
老君廟廟會頗多，主要有 正月十五 上元會、二月十五老君會、三月清明祭祖會、 四月廿八 藥王會、七月十五中元會、九月報恩九皇會、十月十五下元會。其中以 農歷二月十五 老君會最為有名。相傳 農歷二月十五 是老君聖誕，是日老君廟舉辦盛大法事。前往朝山禮聖、趕廟會的信眾，懷抱青香，手捏紅燭，湧上老君廟。從新津縣城老南河大橋至老君廟約 3 公裏 路上，人流綿延不斷。不僅如此，以老君山為核心，方圓十余華裏，到處人頭攢動，摩肩接踵。人與大自然的親密交融，構成了川西平原壹幅十萬余人踏青的民俗風情畫卷。
而今，老君廟是全真道十方叢林，傳續龍門法脈，又承襲古稠粳治遺風，是川西道教重要的活動場所之壹，在中國道教史上和海內外信眾中有著較大的影響。