1、所處位置不同
夾註是夾在正文中間的註解。
腳註是對某些東西加以說明，印在書頁下端的註文。腳註和尾註是對文本的補充說明。腳註壹般位於頁面的底部，可以作為文檔某處內容的註釋。
2、作用不同
夾註內容其初也只限於註疏“經義”,後來發展為包括標明讀音、訓詁文字、辨別語詞、分析章句、考證名物、推求義理、校勘異文,以及註明出處等等內容。甚至連資料性的附錄也都可以雜於註文之中。
腳註和尾註是對文本的補充說明。腳註壹般位於頁面的底部，可以作為文檔某處內容的註釋。尾註壹般位於文檔的末尾，列出引文的出處等。
3、用途不同
夾註的宗旨是不變的，即為了方便讀者，使之更全面更深刻更準確地理解正文。
腳註的作用是用以做註文。
隨著標點符號的普遍使用，以及橫排印刷的流行，夾註在使用“夾註號”(如各種形式的括號)的情況下，字形可同正文壹般大，但為了便於區別正文與註文，註文多變換字體。橫排印刷壹般不用雙行夾註,多用夾註號標明夾註文字。
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