我們都知道三清是誰，但是怎麽區分他們呢？元石天尊又名“玉清元石天尊”。在“三清”中，它是最受尊敬的，也是道教神仙中的第壹神祗。《歷代神仙鏡》稱他為“主持天庭之祖”。雖然他的地位很高，但他比老先生出現得晚。道教形成初期，並無“初佛”之說，《太平經》、《香兒註》中也無記載。在中國的神話傳說中，找不到起源。
莊嚴肅穆的道教三清殿裏，通常供奉著三尊威嚴的神靈，這就是道教的最高神靈——“三清祖師”。站在三清殿門口的三清，是道家哲學“三位壹體”理論的象征，即殿中玉清元石天尊像，左上方靈寶天尊像，右上方太清道德天尊像。
後來道教由此衍生出三神。所以“三清”本尊是道教神仙體系中最受尊崇的。《道術樞》第七卷引用《太真科》說:“羅達生有三元玄氣，化為三清天道:壹日晴空萬裏，始成；第二天，魚雨去了清朝。第三是天空太清澈，氣氛神秘。從此三種氣分別誕生。”據《雲七圖》、《法會元之道》等道教書籍記載，清者清，混穴太虛，其氣始青，真道升至聖境，天寶尊(元神)統轄；魚雨餘日入清，其氣為黃，仙路升至真態，靈寶尊之；天太清，氣玄白；人文上升到壹個仙境，道家住在裏面。文曰:“這四種人與天，即三界之上，不如四種人與天有三界分明。三清之上是大羅田，元代佛祖在此居住講學。天寶君智在玉清境界，天高雲淡。靈寶君旨在清，即魚雨天野，神寶尊(道德天尊)在清，即大持天野。”(《七年雲》卷三，《道初》)據《集註·釋真》雲《讀經略》雲:“三清人居玉清聖地，元朝始居；清聖境，道君居之；太清仙境，老先生住的地方。”同時，道教對三清神靈的崇拜也體現了道教“三窟真經”的神化。《雲七章》卷六三孔經教處雲:“大門上，雲有三孔者，謂之孔。宣彤很棒，有三個系統，所以雲上有三個洞。第壹洞是真的，第二洞是神秘的，第三洞是神。是三場的神秘目的，也是八大的精神篇章。”根據《衛青神位在衛青道法樞紐》的記載，《道法會元》卷壹；元初聖祖代表苗道東部，輔佐太玄，傳播衛青學派；衛青玄祖在慶齡扶余聘大道君，代表董璇京部，太平為輔，傳承靈寶派；太清道德五靈始祖玄老君，代表董神經系，太清為輔，“壹盟壹威”之道貫穿三窟，傳播道德派和正統派。