文學院成立中國古代文學研究所。目前本所擁有中國古典文獻學和中國古代文學兩個博士點暨碩士點。中國古典文獻學是國內第二批博士點學科，1984年獲得博士學位授予權，現設有文學古籍整理與研究、古代文獻學研究等研究方向。中國古代文學是國內第四批博士點學科，1990年獲得博士學位授予權，現設有先秦兩漢魏晉南北朝文學、唐宋文學、元明清文學等研究方向。
古籍研究所成立於1981年，是由原國家教委批準成立的全國第壹個古籍整理研究機構。該所以整理研究中國古代（尤其是元代）文獻為主要發展方向。
2 優勢不同
文學院從本科到博士都有，除了文獻學還有很多其他方向，古籍研究所就那壹個專業。
數十年來，北京師範大學的中國古典文獻學和中國古代文學學科形成了深厚的學術傳統和良好的學術風氣。在學術思想上，兩個學科堅持文、史、哲溝通兼容的大文學史觀念。在治學方法上，兩個學科繼承清代學者“義理、考證、辭章”三位壹體的優良傳統。在研究對象上，兩個學科重視文學文本的探幽索隱和作家的心態發微，也重視探求各種文學史現象縱向的傳承演變軌跡和橫向的錯綜復雜聯系，對各種文學史現象進行全方位、多角度的綜合研究和比較研究。在研究領域上，兩個學科在中國古代散文研究、中國古代戲曲小說綜合研究、中國古代文學學術史研究等方面，成果豐碩，特色顯著。
文獻研究不只是個技術活，個人認為文學院體系更完善積澱更深厚，資源更豐富。
3 師資力量
這個我就不多說了，妳自己去網站對比壹下就明白了。文學院文獻學的導師貌似是郭英德教授，郭英德教授是教育部人文社會科學跨世紀優秀人才，致力於中國古代戲曲史和戲曲文獻、元明清文學、中國古典文學學術史等領域的學術研究，有《明清文人傳奇研究》、《中國古典文學研究史》(合著)、《明清傳奇綜錄》、《明清傳奇戲曲文體研究》、《中國古代文體學論稿》等著作。基本也屬於鎮院之寶壹級的人物了。其他知名教授還有很多，網站都有妳仔細看吧。
個人意見，兩院系明顯側重不同，選擇壹個適合妳的，且妳喜歡的吧。