建國以後，三聯書店壹度和人民出版社合並，主要出版哲學、經濟、歷史著作和翻譯讀物以及內部參考書。在出版家範用的帶領下，壹批膾炙人口的書籍出版，他策劃出版的巴金的《隨想錄》，楊絳的《幹校六記》等，在當年起到了重要的作用。而1981年出版的《傅雷家書》反復重印，印數已超過百萬。
1986年，三聯書店恢復獨立建制，沈昌文成為總經理。在他接掌三聯書店以後，三聯書店的經濟狀況得到了改善，壹部《情愛論》印了120萬冊。後來出版的《金庸全集》、《蔡誌忠古籍經典漫畫》等港臺版書籍更是讓三聯走上了壹條更為多元的道路，改變了被主流文化不恥的武俠小說、漫畫等書籍的狀況，使這些說逐漸流行起來。金庸作品被大量出版，三聯版的《金庸全集》也成了讀者希望收藏的最佳版本。三聯書店業出版了諸如《陳寅恪的最後20年》《黃仁宇作品系列》等大量優秀的人文書籍。 董秀玉是沈昌文之後的三聯的出版人。在她的主持下，《陳寅恪文集》《錢鐘書集》和楊絳的《我們仨》等壹系列高水準的書籍得以出版。 三聯書店自成立之後，發展越來越多元化，但最初三店***同辦雜誌的傳統仍然延續著，1979年創辦《讀書》雜誌，《讀書》壹直是中國知識分子十分鐘愛的壹本雜誌之壹，始終擁有壹批忠實的讀者，是同類刊物中當之無愧的帶頭刊物。此外三聯還出版了不少有影響力的雜誌。
1995年出版的《三聯生活周刊》，定位在做新時代發展進程中的忠實記錄者，有中國的《時代周刊》之稱。1993年創刊的《愛樂》，為國內頗負盛名的唯壹壹本古典音樂評論雜誌，擁有高素質的音樂評論撰稿人，深受古典音樂愛好者的喜愛。創刊於2002年的《競爭力》月刊，是中國加入WTO之後創立的第壹份財經期刊，以獨家調查、深度分析、客觀評述為辦刊宗旨，創刊之初已頗具影響力。