吉林大學圖書館前身為東北行政學院圖書館，1946年創辦於哈爾濱。1948年與哈爾濱大學圖書館合並。1952年改稱東北人民大學圖書館。1958年隨校名改稱吉林大學圖書館。2000年6月，原吉林大學、吉林工業大學、白求恩醫科大學、長春科技大學和長春郵電學院合並組成新吉林大學，原五校圖書館也隨之合並。
建立了以人文、社會科學、理學、工程技術科學、醫學、地質科學和信息科學文獻為主體的多種類型、多種載體的綜合文獻資源體系，覆蓋了人文社科、理工農醫軍等全部十三大學科。藏有各類紙質書刊585萬余冊，其中古籍40萬冊，古籍中6000余部為善本。地方誌與譜牒、金石拓片與古文字文獻的收藏在高校圖書館中名列前茅。訂閱外文期刊1268種，中文報刊4914種。圖書館註重數字化文獻資源的建設，購買了包括web of science和EI在內的48種西文文獻數據庫，中國知網等14種中文數據庫，超星、書生等電子圖書140萬冊，自建了東北亞研究、地學、汽車、滿鐵資料等12個數據庫。
吉林大學圖書館現是中國高等教育文獻保障系統（CALIS）東北地區中心，大學數字圖書館國際合作計劃（CADAL）項目成員館，中國高校人文社會科學文獻中心（CASHL）東北區域中心，教育部引進文科圖書中心書庫，教育部化學學科外國教材中心，文化部第二批全國古籍重點保護單位，教育部科技查新工作站，吉林省高校圖工委秘書處所在館。