《興化縣誌》說他自幼聰明，才華橫溢，工詩文，擅書畫。嘗為諸生，頗有名望。但早歲事舉子業，九試而不中，於是棄儒學道，入山隱居。數次遇異人，得受仙道秘訣。後聲言呂洞賓降臨其北海草堂，住二十二日，親授丹訣。
關於此次遇仙奇遇，其《金丹就正篇.自序》說：“嘉靖丁末，偶以因緣遭際，得遇法祖呂公於北海之草堂，彌留款洽”，“嗣後常至其家。……既以上乘之道勉進潛虛，並授以結胎之歌，入室之旨，及呂公自記數十則，終南山人集十卷。……研尋二十載，流光如箭，甲子嘉平(陰歷十二月)潛虛乃遁於荒野……遂大感悟，由是入室求鉛，不數載而事畢。” 又稱：“甲子嘉平，……復感恩師示夢，去彼掛此，遂大感悟。追憶曩所授語，十得八九；參以契論經歌，反覆繹，寤寐之間，性靈豁暢，恍若有得，乃作是篇。”
陸西星的思想頗具代表性，他提出了“性命雙修，此本成仙作佛為聖之大旨”，竭力將三教思想相融合。稱呂洞賓曾降臨他所居住的北海草堂，親授丹法，據此撰成《賓翁自記》與《道緣匯錄》。並撰《七破論》，抨擊其它煉養方術。後世道士將他尊為內丹東派之祖。著作有《金丹就正篇》壹卷，《玄膚論》壹卷，《老子道德經玄覽》等，收入《方壺外史》。晚年參禪學佛，又撰有《楞嚴述旨》十卷等。
傳說與史實陸西星自幼聰穎，異於常人。“束發受書，輒悟性與天道之旨”。嫻文辭，攻書畫。嘗為諸生，頗有名望。但早歲事舉子業，九試而不中。乃棄儒為道，入山隱居。數次遇異人，得受仙道秘訣。後聲言呂洞賓降臨其北海草堂，住二十二日，親授丹訣。關於此次遇仙奇遇，其《金丹就正篇.自序》說:“嘉靖丁未，偶以因緣遭際，得遇法祖呂公於北海之草堂，彌留款洽”，“嗣後常至其家。……既以上乘之道勉進潛虛，並授以結胎之歌，入室之旨，及呂公自記數十則，終南山人集十卷。……研尋二十載，流光如箭，甲子嘉平(陰歷十二月)潛虛乃遁於荒野……遂大感悟，由是入室求鉛，不數載而事畢。”又稱：“甲子嘉平，……復感恩師示夢，去彼掛此，遂大感悟。追憶曩所授語，十得八九；參以契論經歌，反覆繹，寤寐之間，性靈豁暢，恍若有得，乃作是篇。”陸西星認為自己深得呂洞賓真傳，故著書立說，闡發內丹之旨，開內丹東派，被後世道教尊為內丹東派之祖。
生平經歷明嘉靖二十六年丁未（1547年），二十八歲。 於本年秋季，與姚四溟“同被師眷”，在北海草堂遇呂祖（呂洞賓）傳授
明嘉靖二十七年戊申（1548年） 二十九歲。 據《三藏真詮》記載，是年得到了呂祖及劉海蟾的傳授。
明嘉靖二十九年庚戌（1550年） 三十壹歲。 為“衣食奔走，與師契闊”數年。
明嘉靖三十三年甲寅（1554年） 三十五歲。 西星外出歸鄉。 明嘉靖三十四年乙醜（1555年） 三十六歲。 興化水災，西星困窮，拾取水中穗}以充饑。但仍然研究丹法不輟。
明嘉靖三十五年丙辰（1556年） 三十七歲。 研究丹法，多有所遇。
明嘉靖三十六年丁巳（1557年） 三十八歲。 其時倭寇犯浙江、福建，人皆倉惶而走，獨西星念老母年邁，不肯遠走。
明嘉靖三十七年戊午（1558年） 三十九歲。 嘉靖三十七年、三十八年、三十九年連續三年，西星皆客居金臺。
明嘉靖己未三十八年（1559年） 四十歲。 同學趙宋中進士，趙宋累官至寧武兵備副使、山西行太仆寺卿，為官守正不阿，歸裏後經常與陸西星、伯兄趙遵陽研討丹法，自號昆丘外史。
明嘉靖三十九年庚申 （1560年） 四十壹歲。 二月，好友宗臣病死於福建，得年僅三十六歲，西星有詩哀之。
明嘉靖四十年辛酉（1561年） 四十二歲。 得地於灌河之濱，其東辟為大園，建宅於高樹之西，西星自認為“適合仙旨，事皆前定。”
明嘉靖四十三年甲子（1564年） 四十五歲。 十二月，完成陸氏第壹篇丹道文章《金丹就正篇》。
金丹就正篇在此篇序言中寫道：“甲子嘉平，予乃遁於荒野，覽鏡悲生，二毛侵鬢，慨勛業之無成，知時日之不待。復感恩師示夢，去彼掛此，遂大感悟，追憶囊所授語，十得八九。參以契論經歌，反復繹，寐寐之間，性靈豁暢，恍若有得，乃作是篇。孔子曰：‘溫故而知新。’今予所溫者故也，而所知則新也。雖壹時臆度之言，未敢就正有道，然亦庶幾不背吾師之旨乎！”
思想與著述陸西星是兩宋、元明道教房中術及內丹雙修理論的集大成者。 他對《參同契》、《遇真篇》、《陰符》等的闡釋，頗有超過宋元註釋之處。他主張陰陽同類雙修，認為“男女陰陽之道順之則生人，逆之則成丹”。並撰成《七破論》，抨擊其他煉養之術。在金丹命術方面主張“真火無候、大藥無斤”，不應拘泥於繁瑣法度。
陸西星著作另有《金丹就正篇》壹卷，為道教內丹學史上第壹篇有關雙修問題的專論。《玄膚論》壹卷，是內丹學通論，討論了諸如三元丹法之相互關系，內外丹之劃分，先後天之區別，修性了命之聯系等壹系列至關重要的理論問題。以及《老子道德經玄覽》等。收入《方壺外史》。晚年參禪，又作《楞嚴述旨》十卷，《楞嚴經說略》壹卷。
3.壹些學者對封神演義作者疑存，認為是陸西星著。 據清·無名氏《傳奇匯考》卷七“《順天時》傳奇解題”雲：《封神傳》傳系元時道長陸長庚所作，未知的否？張政R在《〈封神演義〉漫談》壹文中，據此認為陸西星是《封神演義》作者，“元時”乃“明時”之誤。陸長庚名西星，是明代揚州府興化縣人，生於十六世紀後期，《陸仲遠詞稿序》說西星“以諸生讎學使賈禍”，有壹定的造反精神。因“九試不遇，遂棄儒服為黃冠”。 明施有為萬歷中選《明廣陵詩》卷二十二收陸西星二十四首，有“出世已無家”之語。張政R還考證陸西星出家後是呂巖（洞賓）道派人，所以在《封神演義》中出現陸壓道人，影射呂祖。