“段玉裁曰：‘校書之難，非照本改字不訛不漏之難，定其是非之難。’所謂理校法也。遇無古本可據，或數本互異，而無所適從之時，則須用此法。此法須通識為之，否則鹵莽滅裂，以不誤為誤，而糾紛愈甚矣。故最高妙者此法，最危險者亦此法。昔錢竹汀先生讀《後漢書·郭太傳》，太至南州過袁奉高壹段，疑其詞句不倫，舉出四征，後得閩嘉靖本，乃知此七十四字為章懷註引謝承書之文，諸本皆儳入正文，惟閩本獨不失其舊。今《廿二史考異》中所謂某當作某者，後後得古本證之，往往良是，始服先生之精思為不可及。經學中之王、段，亦庶幾焉。若《元典章》之理校法，只敢用之於最顯然易見之錯誤而已，非有確證，不敢藉口理校而憑臆見也。”
即碰到古書無可依據，或數本無所適從時，只好用理校法，以理分析，斷其是非。它通常根據史書的體例原則、遣詞造句的特色來校勘，需要研究者對古籍、音韻、訓詁、歷史、典故等知識有很深的造詣。