幹寶原撰《搜神記》有30卷，流傳至今只有20卷，454篇故事。
坊間的《搜神記》並非原始的完整版本，原本多散佚，後人再從《北堂書鈔》、《藝文類聚》、《太平禦覽》、《法苑珠林》等書輯錄而成的，才成為今天所見的二十卷本《搜神記》。
幹寶的《搜神記》名氣太大，除了歷代輾轉傳抄之外，連襲用書名的情況也屢見不鮮，同樣叫做“搜神”的至少就有陶潛《搜神後記》、北魏曇永《搜神論》、唐代句道興《搜神記》、宋代的《搜神總記》、元刊《新編連相搜神廣記》、明代羅懋登六卷本《搜神記》、焦璐《搜神錄》（即《窮神秘苑》），明代還有壹個八卷本《搜神記》幹寶的《搜神記》原書似乎在宋元間就已散佚了。
《隋書·經籍誌》載（晉）陶潛撰《捜神後記》十卷，是後人偽托。
《密冊匯函》刻本。
《搜神記》另有日文譯本。
汪紹楹的《搜神記校註》。
近人李劍國輯校的《新輯搜神記》30卷及《新輯後搜神記》10卷。
白話本有三民書局的《新譯搜神記》、臺灣古籍出版社的《搜神記》。