日本漢字的寫法基本上與現代中文使用的漢字大同小異。古代日本完全使用文言文，自近代以來，出現壹部分由日本人獨創的漢字，稱為日制漢字或和制漢字，日本官方定為國字，當中部分已被中文收錄，現在和制漢字主要是未被中文收錄的漢字。
《諸橋大漢和辭典》是最大的日本漢字字典，***記載接近5萬個漢字，不過在戰後的現代日文中常用的漢字大約只有兩千餘個。
和制漢字
國字（辻）
日本漢字多數直接借自中文漢字，但亦有百餘個漢字是由日人根據中國漢字的六書自創的「會意」或「形聲」漢字。這些日本自家創造的漢字，不同於中國大陸通行的簡化字，而是只限於日本語使用的漢字。這些漢字在日本稱為「國字」或「和制漢字」：
峠（とうげ；touge）：山口，鞍部。
榊（さかき；sakaki）：楊桐，常綠樹。
畑（はたけ；hatake）：旱田，田地，專業的領域。
辻（つじ；tsuji）：十字路口，十字街，路旁，街頭。
働（はたらく；hataraku）：工作。
躾（しつけ；shitsuke）：教養。不常用，同“仕付け”。
部分漢字亦逆輸出至其他漢字文化圈地區。如現代中文收錄：“呎”、“腺”、“癌”、“鱈”。國訓
部分日本漢字的意思和原來中文漢字的解釋有所出入。這些漢字被稱為「國訓」：
沖oki（外海，取其「水中」之會意）
椿tsubaki（山茶花）
字體
部分漢字有「舊字體」和「新字體」之分，類似中文的繁體字和簡體字的差別：
新字體：國；舊字體：國；音讀：こく（koku）；訓讀：くに（kuni）
新字體：號；舊字體：號；音讀：ごう（gō）
新字體：変；舊字體：變；音讀：へん（hen）；訓讀：かわる（kawaru）
舊字體在二次大戰之前使用，1946年由文部省引入新字體。
日本新字體基本上是通過去掉筆畫的方式，但有例外。常見的如
新字體：歩；舊字體：步；音讀：ほ、ふ、ぶ（ho, fu, bu）；訓讀：あるく、あゆむ（aruku, ayumu）
新字體：賓；舊字體：賓；音讀：ひん（hin）[1]
非但沒有減少，反而增多。以上兩字都含有“少”字缺壹點的部分，新字體就乾脆寫成“歩”。但也有例外，如「捗」。
還有些新字體成為了近義字或同音字取代（按：此處指日語中，不以中文為基準思考），如
新字體：欠；舊字體：缺；音讀：けつ（ketsu）；訓讀：かける（kakeru）；（中文「缺」「欠」不同字。）
新字體：缶；舊字體：罐；音讀：かん（kan）；（中文「缶」「罐」不同字。）
新字體：死；舊字體：屍；音讀：し（shi）；訓讀：しぬ（shinu）；（中文「屍」「死」不同字。「屍體」新字體寫作「死體」。）
新字體：部；舊字體：篰；熟字訓讀：「篰屋，heya」變成「部屋，heya」
有些新字體被簡化到被另壹個毫無關聯的字來代替。如：
新字體：蕓；舊字體：藝；音讀：gei；新字體只保留了舊字體的草字部「艹」與底部的「雲」。
原本「蕓」音讀是「うん（un）」，訓讀是「くさぎる」（kusagiru），是「草（kusa）」和「切る（kiru）」的合成詞，即除草的意思。新字體裏這種讀法已經廢除了。