壹、主體不同
1、exe：譯作可執行文件，可移植可執行 (PE) 文件格式的文件。
2、zip：ZIP文件格式是壹種數據壓縮和文檔儲存的文件格式。
二、運行方式不同
1、exe：可以加載到內存中，並由操作系統加載程序執行，是可在操作系統存儲空間中浮動定位的可執行程序。
2、zip：支持基於對稱加密系統的壹個簡單的密碼，現在已知有嚴重的缺陷，已知明文攻擊，字典攻擊和暴力攻擊。
三、組成不同
1、exe：exe文件包含壹個文件頭和壹個可重定位程序的映像。文件頭包含MS-DOS用於加載程序的信息，例如程序的大小和寄存器的初始值。
2、zip：zip 文件格式由三部分組成：zip 壓縮數據段、中央目錄區、中央目錄區尾部。
百度百科-Zip
百度百科-exe文件