查理壹世統治時期的另壹個特點是混亂的宗教沖突。臣民普遍不信任他們國王的信仰。壹方面，他的錯誤成功地幫助了三十年戰爭中的新教勢力，但另壹方面，他娶了壹位羅馬天主教公主。
查理壹世也重用了當時有爭議的教會人物。他的許多臣民認為這使得英格蘭教會和羅馬天主教會的關系過於密切。之後查理壹世還試圖強迫蘇格蘭進行宗教改革，導致了主教戰爭。這些都使得英格蘭和蘇格蘭的議會立場堅定，最終促成了查理壹世的滅亡。
在查理壹世的最後幾年，他和國會之間爆發了英國內戰。同時，他制定了壹系列宗教政策，引起了以清教徒為代表的加爾文主義者的不滿。查理壹世在第壹次英國內戰(1642-1645)中戰敗後，國會希望他能接受君主立憲制。
然而，查理壹世很固執。他與蘇格蘭結盟，逃到了懷特島。這種行為徹底激怒了議會，導致了第二次英格蘭內戰(1648-1649)。查理壹世再次被擊敗，隨後他被逮捕並因叛國罪被處決。49歲時，君主制隨即瓦解，英格蘭建立了壹個共和國，名為英格蘭聯邦。這個時期也被稱為克倫威爾的空缺期。查理壹世的長子查理二世在父親死後繼承王位，直到1660年復辟才行使決定權。
1633年，查理任命天主教徒威廉·勞德(william laud)為坎特伯雷大主教，並在他的協助下開始向蘇格蘭教會強制推行祈禱書，以統壹兩個王國的宗教活動。蘇格蘭低地的居民被激怒了。他們宣誓支持效忠蘇格蘭長老會的國家誓言，並公開拒絕新的祈禱書。查理勃然大怒，派兵去蘇格蘭實現自己的願望。但是查理在第壹次主教戰爭中被打敗了。
為了籌集資金打第二次主教戰爭，查理不得不再次召集議會。但是立法者要求在討論資金之前討論被壓制的抱怨。但幾周後，查理再次解散議會。這就是“短期議會”。查理第二次出兵攻打蘇格蘭。這壹次，徹底失敗了。誓約占據了英格蘭在諾森伯蘭郡和達勒姆郡的領土，國王被迫支付賠款。1640年，國王再次召集議會，這壹次叫做“長期議會”，此時國王處於議會的支配之下。
在“長期議會”和“短期議會”之間，國王* * *被迫采取多種方式籌集資金:將都鐸時代使用的“造船稅”征收範圍從沿海地區擴大到內陸城市，以維持海軍的需要；非法征收關稅(噸稅和英鎊稅)；征收各種不受歡迎的中世紀稅，比如對拒絕接受騎士身份的鄉紳罰款。這導致了國王* * *和由新興鄉紳、商人、律師組成的下院的對立，他們認為國王的所作所為是違憲的。有些人越來越擔心國王會利用北軍和守衛愛爾蘭的部隊把自己的意誌強加給議會，但查理從來沒有想到這壹點。然而，查爾斯最得力的斯特拉福德伯爵被下議院選為替罪羊，斯特拉福德伯爵是愛爾蘭總督，他和大主教勞德被議會公認為國王的“狗頭軍師”。然後下議院向上議院報告了斯特拉福德的叛國罪。
此時查理也知道了下議院的目的，但他希望斯特拉福德能被證明無罪，這樣國王的權威才能得以保全。但在這個關鍵時刻，國王被要求簽署壹項剝奪公民權利的法案，根據該法案，斯特拉福德可以在沒有法律判決的情況下被處決。此時，上院受到暴動公民的威脅，國王受到他心愛的天主教女王的危險處境的威脅。無奈之下，國王簽署了法案。然後國王放棄了“造船稅”，同意這個長期議會未經自己同意不得解散。國王在兩個問題上沒有向議會領袖屈服:壹是蘇格蘭教會的改革，蘇格蘭教會認為英國教會正在被國王的高級教會主教天主教化；二是對國軍的控制，國軍是除國王衛隊之外唯壹的常備軍。
評價
查理壹世有很多優秀的品質。他隨和認真，是壹個忠誠可愛的丈夫和父親，也是壹個虔誠的基督徒。他也是壹個唯美主義者，願意花錢買漂亮的東西。他邀請了許多優秀的藝術家和作家到宮廷。但他也有嚴重的缺點，比如不夠勤奮，缺乏幽默感。他還認為，只要能贏得戰爭，奪回自己的絕對權威，任何手段都是正確的(類似馬基雅維利的觀點)。因此，他對蘇格蘭的長老會、英格蘭的聖公會、愛爾蘭的羅馬天主教徒和議會軍隊中的清教徒領袖做出了各種矛盾的承諾，而他並不打算遵守這些承諾。就這樣，他漸漸失去了大家的信任。