蒙巴薩發音[mm?b\?s?]。其中“m”和“b”發音清晰有力,而“o”發音為短音[?],弱化“n”和“s”的發音,重讀第壹個和第三個音節。蒙巴薩的名字可能來自斯瓦希裏語單詞“Mvita”,意思是“海角”,也可能來自阿拉伯語單詞“mambra”,意思是“海濱城市”。