核酸分子雜交作為壹項基礎技術,已經應用於核酸結構和功能研究的各個方面。核酸分子雜交具有高度的敏感性和特異性,因此該技術已廣泛應用於分子生物學領域,如克隆基因的篩選、酶切圖譜的制作、基因組中特定基因序列的定性和定量檢測以及疾病的診斷等。因此,它不僅廣泛應用於分子生物學領域,而且越來越多地應用於臨床診斷。
在醫學上,已用於各種遺傳性疾病的基因診斷、惡性腫瘤的基因分析、傳染病病原體的檢測等領域,其成果極大地推動了現代醫學的進步和發展。