邏輯與數學相依為命，邏輯方法即是應用數學的方法來研究思想的概念，來理解自然與人生的事實。邏輯方法的目的在能給我們有普遍性、有必然性的知識。換言之，邏輯方法要給我們堅實可靠、顛撲不滅的知識。必定要這種知識才夠得上稱為科學知識。邏輯方法與數學方法壹樣，有壹個特點，就是不問效用如何、結果好壞、滿足個人欲望與否等實用問題。譬如，有壹個三角形於此，數學不問此三角形有何用處，不問此三角形是誰畫的，更不問畫三角形、研究三角形有何利益。數學只求證明三角之和必等於兩直角，這是三角形的本性或本質，是壹條有普遍性、必然性的真理。所以壹個人是否用邏輯方法思想，就看他是否能掃除那偶然性的事實，擺脫實用的目的，而去探討壹物的普遍必然的'本質。應用邏輯方法來讀書，就要看能否把握其所討論的題材的本質，如是就可以判斷書的學術價值的高下。同時，我們讀壹書時，亦要設法把握壹書的本質或精義，用種種理智的活動以求了解此書的內容。
體驗方法即是用理智的同情去體察外物，去反省自己。體驗法最忌有主觀的成見，要虛心忘我，深入事物的內在本質或命脈，以領會其意義與價值，而不從外表去加以粗疏的描寫或概括。此種方法，用來體察人生，欣賞藝術，研究精神生活或文化創造，特別適用。朱子所說的“虛心涵泳”“切己體察”“沈潛玩索”，都是體驗的方法。應用體驗的方法來讀書，使自己沈潛浸潤於書籍中，設身處地，用壹番心情，費壹番神思，以審美、欣賞藝術的態度去讀書，從中感覺書之可樂可好、智慧之可愛。把讀同代人的書當成與作者交流思想、溝通學術文化的途徑。把讀古書當作與古人晤對的精神生活，神遊冥想於古籍的寶藏裏，與聖賢的精神相交接往來，含英咀華，體會古人真意，發揮自己的心得。由此而深造有得，則其所建立的學說，所發出的議論，自有壹種深厚純樸、中正和平之氣，而不至於粗疏淺薄。
所謂玄思的方法，最簡易地講來，可以稱為“由全體觀部分，由部分觀全體”之法。只知全體，不知部分，則陷於空洞。只知部分，不知全體，則陷於支離瑣碎。必由全體以觀部分，各部分才可以各安其分，各得其所，不致起爭執矛盾。必由部分以觀全體．才可以見得部分的根本所寄、歸宿所在，而不致執著壹偏。如朱子之今日格壹物、明日格壹物，而達到豁然貫通的境界。他又能由太極之理、宇宙之全，而觀壹事壹物之理，而發現本末精粗，條理井然，“枝枝相對，葉葉相當”。用此方法讀書，即是由約而博、由博返約。譬如：讀壹篇文字，由壹字壹句以表明全篇的主旨，就是由部分觀全體之法；由全篇文字的主旨，以解釋壹字壹句應有的含義，便是由全體觀部分之法。此外如由整個時代的文化以觀察個人的著作，由個人的著作以例證整個時代的文化，也可以說是應用由全觀分、由分觀全、多中見壹、壹中見多的方法來讀書。此種玄思的方法，認為著作、思想、世界都是壹有機體，有如常山之蛇，擊首則尾應，擊尾則首應。故讀書，了解思想，把握世界，須用以全體觀部分、以部分觀全體的方法。
總之，要從讀書裏求得真實學問，須有嚴格的方法，以逐漸養成研讀偉大著作的勇氣與能力。