“九州”部分首先依據河流、山脈、海洋作為天然界線，將全國分為9個區域，即冀、兗、青、徐、揚、荊、豫、梁、雍九州，然後，依次敘述九州內的各項地理內容。這種以天然界線吲分區域的做法，在現代地理學上叫做自然區劃，具有很高的地理意義。各個自然區域之間，不僅山脈、河流、湖泊不同，而且氣候、土壤，植被、物產也不同。《禹貢》根據各州自然條件的差異來定田賦的等級，這在當時是很科學、很合理的事情。《禹貢》描述的九州自然條件差異，以土壤、植物最明顯。在九州範圍內，由於南、北方的水分、氣溫不同，形成了不同的土類。《禹貢》是中國第壹部講土壤分布和分類的著作，也是世界上最早的土壤地理著作。
“導山”部分描述了4列山系。因此《禹貢》也可以說是中國古代出現的最早描述山脈系列及其分布的著作。
“導水”部分敘述了黃河、長江、淮河、洛水、渭水、漢水等9條河流的水源、流向、流經地、所納支流以及河口等內容，還記載了榮澤、菏澤、大陸等10個湖泊。可見，《禹貢》還是中國古代最早的陸地水文地理著作之壹。
“五服”部分反映了中國古代統治者的地域觀念和傳統方式。“服”這種地域因距離京城遠近而改變賦制，距離越遠，其政治影響也隨之減弱。每服四方各500裏，層層外延，成甸、侯、綏、要、荒五服。統治者對各服施行的統治辦法是不壹樣的，距離京城近的關系密切；相反，則關系比較松散。由此可見，《禹貢》還是我國最早的政治地理著作。