史學研究
顧頡剛作為壹個史學家，享譽中外學術界，影響深遠。顧頡剛的私淑弟子黃現璠曾說：“解放前，日本學者，特別是名牌大學如東京、京都、帝大教授，都看不起中國學者，惟對於顧頡剛先生和陳垣先生，則推崇備至。”
他將史學上的創見運用到民間文學、民俗學領域來，為之貫註新血液，探討新方法，同樣取得了極大成就。他在孟姜女故事和歌謠學、民俗學諸方面的研究，贏得了很高的榮譽。
1924年，顧頡剛在《歌謠》周刊上連載《吳歌甲集》，歷時三月，獲得學術界好評。《吳歌甲集》於1926年由北大歌謠研究會出版單行本，這是壹部科研價值很高的歌謠集子，不但出版的時間較早，而且有比較詳盡的註釋等，還附有研究文章《寫歌雜記》多篇。劉半農寫信給他說：“中國民俗學的第壹把交椅，給妳搶去坐穩了。”
民俗研究
在民俗方面，顧頡剛作過很多考察研究。對妙峰山的考察，對土地神的探究以及對蘇州婚喪禮節的論述,都不斷有文章發表。在風氣未開的當時，影響頗大。其中《妙峰山的香會》對群眾朝拜碧霞元君女神的盛況作了考察研究，分析各種人朝拜、祈福的迷信心理和廟主假神戚斂財的實質，發現了人民物質生活水平和祈福心理的關系。這體現了顧頡剛不是為調查而調查，為研究而研究的學術觀點。
吳歌研究
1918年，他因病休學在家，因《北大日刊》的影響，開始搜集“怡情適性”的歌謠。他的搜集工作只有八個月，連帶搜集了諺語、方言方音，後來發表於《晨報》，得到“研究歌謠專家”稱號。他的研究成果首先得到來自文學方面的稱贊。胡適說:《吳歌甲集》“是獨立的吳語文學的第壹部”、“道地的方言文學”、“這部書的出世真可說是給中國文學又開壹新紀元了。”他此書突出的成績在於對歌謠結合吳地的地域文化（特別是民俗）進行闡釋；標明歌謠適合的場所、參與者、具體的動作等；不同地域歌謠的變化；特別是它內容詳實的附錄———闡述了從題目的類型到《詩經》以來的爭論。在這種意義上來說《吳歌甲集》“不只是壹個壹般性的歌謠資料集，而是具有較高的科學價值的歌謠學著述了。像這樣比較完善的民間文學整理本，不要說在解放前，就是在解放後也是不多見的”。
故事研究
顧頡剛的孟姜女故事研究，在中國是首次對傳說故事進行精細和系統的考證。他對記載於各種古籍和流傳於當時口頭的有關材料進行分析，對這個故事的產生、傳播及變異狀況進行系統的考證，意在對孟姜女故事起源的時間、地點和情節變化以及與歷史的關系，作出盡可能科學的闡釋。其《孟姜女的故事轉變》和《孟姜女故事研究》是這方面的代表作，從縱橫兩方面提出了故事的歷史系統和地理系統。特別是後文，更加全面而系統地體現了顧頡剛的見解，他最重視“演變法則”，試圖由此來認識故事的源頭、發展及變形。顯然，他是將其古史學說“層累地造成的古史”的觀點運用到這個故事的研究中來的，這使其在這個研究領域裏的成就卓然不群。顧頡剛對孟姜女故事研究的結論，壹直很有影響，特別是其中對故事歷史系統的研究成果，多年來壹直成為定論。後來的許多民間文藝研究者，多在上面作些補充與發揮，他的“演變法則”，也成為至今還在沿用的研究方法。
當然，顧頡剛的孟姜女故事研究，主要目的是“為研究古史方法舉壹旁證的例”，是將傳說作為研究歷史的資料。研究結果表明，從孟姜女故事已看不清杞梁妻的真正歷史面目了。既然如此，傳說中記載的其他古史現象也便不可信了。這才是顧頡剛研究孟姜女故事的真正目的，文章中貫穿了新疑古派的思想與方法。在古史研究中，顧頡剛還涉及到許多古神話傳說故事，對堯、舜、禹等神話傳說均有研究。
顧頡剛為中國民間文藝理論建設作出了很大貢獻。他那種對民間文藝作出了很大貢獻。他那種對民間文藝作動態考察的眼光（“演變法則”）和對古籍資料搜求鑒別的真知灼見，曾給我國民間文藝研究以巨大影響，他研究中被及到壹些神話傳說人物、事件等，成為後來壹些人的研究課題。除此，單就他在主編雜誌、主持學會、宣傳民間文藝、提醒帶動同人進行民間文藝研究方面作的辛勤努力和所起的倡導性作用而言，其功勞也是異常卓著的。 《古史辨》（第壹至第七冊），上海古籍出版社，1982 （重印本） 《漢代學術史略》，人民出版社，2008 《中國疆域沿革史》，商務印書館，1999 《中國影戲略史及其現狀》 《崔東壁遺書·序言》，亞東圖書館，1936 《古籍考辨叢刊》（第壹集），中華書局，1955 《史林雜識》（初編），中華書局，1963 《秦漢的方士與儒生》，上海古籍出版社，1978 《尚書通檢》，上海古籍出版社，1990 《中國歷史地圖集（古代史部分）》，（與章巽***同編寫，譚其驤校訂） 《中國上古史研究講義》，中華書局，1988 《顧頡剛古史論文集》（第壹至第三集），中華書局，1988 《顧頡剛讀書筆記》，臺灣聯經出版事業公司，1990 《漢代學術史略》，東方出版社，1996 《中國現代學術經典·顧頡剛卷》，河北教育出版社，1996 《浪口村隨筆》，遼寧教育出版社，1998 《中國當代史學》，遼寧教育出版社，1998 《中國疆域沿革史》，商務印書館，1999 《我與〈古史辨〉》，上海文藝出版社，2001 《西北考查日記》，甘肅人民出版社，2002 《〈尚書〉校釋譯論》，中華書局，2005 《顧頡剛全集》，中華書局，2010 《國史講話》，中華書局，2010 《顧頡剛日記》，中華書局，2011 《國史講話全本》，上海人民出版社，2015