1、地理位置方面。昆明博物館位於昆明市盤龍區拓東路東段，交通方面。而雲南博物館位於昆明市五華區廣福路，地理位置較差，交通比較不方便。
2、口碑方面。昆明博物館是集文物保護、文化遺產研究、文物展覽、教育宣傳和科學研究於壹體的國家壹級博物館。而雲南博物館只是中國西南地區規模最大、最權威的綜合性博物館。