早在唐朝貞觀元年(627年)，朝廷就在海南島設立崖州總督署，掌管全島。同時分析瓊山縣。因縣內有壹座山，山上的石頭潔白潤澤如玉，故稱瓊山(今海口市瓊山區甲子鎮仙民村)，故以山命名，瓊山縣的名稱由此開始。縣長位於海口市瓊山區舊州鎮舊州村。唐朝貞觀五年(631)，雅周瓊山郡，設在瓊州，國政公署仍在九洲村。貞觀十三年(639)，瓊州被廢，瓊山縣屬雅州，不久恢復。乾豐元年(666年)，當地土人造反，瓊州被俘，名存實亡。100多年後，貞元五年(789年)，嶺南巡撫李福才收復瓊州，接掌瓊州總督署，統領瓊州、崖、鎮、雲、萬安五州23縣，停崖總督署。海南從此叫“瓊”。此後，除了南漢的瓊州、宋代的瓊州、元代的瓊州軍民安撫部、明清光緒三十壹年(1905)四月前的瓊州府，雖然名稱略有不同，但都冠以“瓊州”二字，是掌管海南的最高行政機構。
1988 4月13日，第七屆全國人民代表大會第壹次會議通過了關於設立海南省的決定，決定將海南行政區域從廣東省分離出來，簡稱海南省，設立海南經濟特區，首府為海口市。