最早出現善本概念是宋代，是指版刻書籍的精品。善就是好的意思，“善本”的原始內涵指那些版刻古籍中的校刊好、裝幀好，時代久、流傳少，具有學術價值和歷史價值的書籍。版刻書籍是用木版雕刻文字印刷成書，唐以前沒有發明印刷術，用刀筆刻寫筆刻在竹簡、縑帛、紙和羊皮上。唐發明了模印法後，宋的雕版印刷已經非常發達，書籍發行量大增。印書分官刻和民刻，官刻是由朝廷經辦的，質量好。民間作坊質量參差不齊，裝幀、脫字、訛字、紙張、字跡等存在種種問題。宋代是版刻鼎盛時期，於是出現了對善本和不善本的研究。
不同版本書籍收錄文獻多寡、校勘精劣程度各不相同，就有了足本和殘本、精本和劣本的差別；書籍版本出現早晚、珍稀程度不同，就有了古本和今本、孤本和復本的差別。善本的內涵也比原來更擴大了，以後許多學者對善本的概念不斷總結歸納，最後形成了現在通用的善本“三性”、“九條”說。
善本的時代下限，現在壹般確定在清乾隆六十年（公元1795年）。