陳修園壹生著作頗豐,多為開蒙普及讀物,有《傷寒論淺註》《傷寒醫訣串解》《傷寒真方歌括》《長沙方歌括》《金匱要略淺註》《金匱方歌括》《靈素節要淺註》《醫學實在易》《醫學三字經》《神農本草經讀》《醫學從眾錄》《十藥神書註解》《時方妙用》《十方歌括》《景嶽新方砭》《女科要旨》等。
《醫學三字經》是其畢生臨床經驗的高度總結,以三言韻語的體裁介紹了醫學源流及各種常見病的病因病機、辨證治則、有效方藥,言簡意賅,朗朗上口,完備而實用,是初學中醫的良好入門讀本。