最近兩岸故宮開始互相官方訪問與交流, 相關之議題也成為群眾之焦點, 大家有興趣的是臺北故宮館藏偏向哪壹方面呢?與北京故宮又有什麼不同呢? 當初挑選裝箱運至臺灣的文物, 著重具有在中華文化延續性的文物, 也就是著重在各朝歷代的重要文物。但由於時間以及載運船只不足, 因此大件器物大多舍棄不帶。也因此大件器物成為北京故宮的特色比如大禹治水玉山以及磁王等。然,臺北故宮帶走的器物,以當時的博物學來說, 皆多為上上等。比如: 在書畫方面, 當時記載於宣和畫譜, 石渠寶笈, 秘殿珠林 中幾乎當時國民政府所能拿到的全部的宋元以及重要繪畫皆裝運至臺灣,比如書法好了宋代是代表了中國書法的巔峰,蘇軾, 黃庭堅, 米芾,蔡襄 這四人更是宋代書法公認最好的,可惜的是我國內博物館中能藏有壹幅蘇軾, 黃庭堅, 米芾,蔡襄真跡的真的屈指可數,但臺北光是米芾的真跡就有78福,且件件是代表作,比如上海博物館的鎮館之寶宋 米芾《蘇太簡參政帖》,但比起臺北蜀素帖又差上壹截了,更遑論臺北故宮珍藏的赤壁賦 這千年前蘇軾的真跡了。而繪畫當時幾乎是全部裝箱南遷,南遷中除了不重要的清代帝王的手跡,歷經宋元明清歷代珍藏的的書畫史上的代表作更是幾乎都帶去臺灣了除了及少數留在宮中的,則大多為來不及清點或是在當時有爭議的書畫, 比如徽宗的聽琴圖。
在青銅器方面, 當時選擇自兩晉、隋唐、宋、元、明、清代, 歷代王朝交替而傳下來的傳世國器以及重要史料價值的河南出土的陰虛文物裝運至臺灣。因此運到臺灣的傳世青銅器是全世界第壹的,比如毛公鼎(世界銘文最多的重器),散式盤(世界最早的銘文土地議合契約)周宗鐘(兩千六百多年前天子祭祀用的國之禮器), 而在瓷器方面選擇在該種類中最為精美的,比如紅寶石僧帽壺就是傳世最好的紅寶石宣德款瓷器, 再比如當時所能找到依據”埏埴流光測”中記載的23件汝瓷全都帶來了臺灣。所謂“天下名瓷，汝窯為魁”, 如果汝窯是瓷器中的第壹的話那這件收藏於臺北故宮的北宋汝窯青瓷無紋水仙盆就是汝瓷中第壹了, 因為她是現存汝磁中唯壹完美無暇 幾乎看不到顯著開片的北宋汝瓷。 此外臺北故宮當時著重在年代較久遠的宋代五大名窯,因此五大名窯幾乎重要作品悉數都運到了臺灣。而之後的元代以及明代清代希珍瓷器,比如元朝青花, 成化鬥彩, 萬歷五彩的最精美作品, 特別是康雍乾三代最重要的瓷器-琺瑯彩瓷, 當時皇宮中只剩下460幾支, 其中460件被帶到了臺北故宮。再器物方面(當時僅簡單分為這幾類) 著重在點集中有記載的器件, 比如乾隆欽定《西清硯譜》所收載之中華古硯正譜為二百方、另有附錄者為四十方，總計為二百四十方。藏於臺灣故宮博物院95方。或是皇宮禦用珍玩(比如多寶閣), 或是具有特別難得雕刻技法(比如痕都斯坦玉器), 這是種壹器壹色 薄胎如蟬翅的玉器, 乾隆詩雲：「西昆率產玉，良匠出痕都。」痕都斯坦玉精品，原均集中於北京紫禁城內乾清宮暖閣內與圓明園殿座之中。乾清宮於乾隆歸政前，被壹場大火燒得精光。圓明園則在八國聯軍時被毀, 因此所有現存古籍善本所提及的痕都斯坦玉精品當時幾乎全都到了臺北故宮。
再善本古籍方面,運到臺灣的也都是件件是寶,比如文淵閣四庫全書,是所有四庫全書中最為精美且最好的,辭藻堂的四庫全書薈要是乾隆最愛的壹套書本來有2套,壹套在圓明園,壹套在辭藻堂,但是圓明園的那套被燒毀了,今只剩下臺北故宮的那套, 嘉慶珍藏的宋板175部<宛委別藏>,如今這幾套都只能在臺北故宮才能看到,此外當時的國民政府中央圖書館的宋元古籍,也全數運到臺灣,加上三百多部"天祿琳瑯"臺北故宮館藏的宋元古籍就達三千冊以上,不但世界第壹,相較1950年建國初期國內各大機以及構博物館竟無壹部宋元古籍,雖經過數十年的努力但也多為殘本,加上後來臺北故宮從美國國會圖書館要回的100大箱原北平圖書館珍藏的歷代珍貴善本書,臺北故宮再善本書的收藏足以讓世界其他博物館望其項背了,而且因為自古中國即是亞洲第壹大國,因此臺北故宮承襲清宮舊藏的搜藏其範圍更是涵蓋了全亞洲,因次數十年間被公認為亞洲最偉大的博物館以及所藏文物總歷史價值為亞洲最高的博物館。更被部分人認為是世界四大博物館
在文物保護方面北京故宮發生竊案非頭壹遭，臺北故宮卻可以「零紀錄」自豪，透過現代化設備打造滴水不漏的安全等級。臺北宮表示，無論在人力或機器設備上都有嚴格的防護措施，例如有警衛、警犬駐點巡邏、陳列室設安全管理人員；電子設備警示如監控系統、防爆裝置；割破玻璃會有所感應的碎音裝置；館內外布滿紅外線偵測系統，即便在壹片黑暗中仍然清晰可見。監控中心全年無休，每日24小時作業由中央電腦監控系統掌握院區安全及預警情報資料之搜集；其次，駐警隊負責守護文物、執行警戒巡邏、門禁管制，全面防竊、防搶、防制破壞；管理員負責陳列室巡察及秩序維護等狀況。
「我們的文物都有防爆玻璃櫃罩住，沒有暴露在外。」加上四周墻壁與地底都有極厚的防護層，就如銅墻鐵壁壹般。臺北故宮在建造之初便設定成專供文物展出之用的博物館，為現代化建築；相較之下原為皇帝寢宮、處理朝政大事的紫禁城，屬於木質結構的古建築群，並非密閉式，要做到恒溫恒濕的保存條件較困難，多年來也歷經不少次翻修。
故宮同時強調，在文物維護的硬體方面隨時更新、升級，相關人員也會定期進修。3月時故宮曾傳出斷電意外，故宮事後澄清並非安全系統停擺，而是陳列室畫面因電線跳電無法送進監控室，當下便調派大批警力人力前往現場巡邏，另壹方面重新開機處理恢復正常運作，未影響觀眾參觀權益。
所以早期有人說北京故宮有宮無寶, 臺北故宮有寶無宮, 但是北京故宮經過這數十年來從全國各地徵集以及許多海內外人士的無私捐獻, 加上許多考古挖掘, 館藏文物回到了180幾萬件, 如果扣除瓷器標本破片, 以及不完整的器物, 或不具歷史價值的文物, 精品部份大約有30萬件, 這加上考古挖掘也補足了北京故宮文物的豐富性。所以單看壹個部分都是不全的。在分類方面, 由於當時清朝才滅亡不過20年因此當時帶走時認為清宮的服飾是不重要的, 但現在卻恰恰成為北京故宮寶貴並引以為傲的收藏, 再比如當時沒來得及運走的明清官窯, 也成為北京故宮重要的收藏,這與臺北故宮宋代五大名窯的收藏架構起完整的中華瓷器歷史。自解放以來, 北京故宮大肆收購了揚州八怪等明末清初時期的畫家。恰好與臺北故宮收藏唐宋書畫成為互補。所以不論臺北故宮還是北京故宮好。這是沒有意義的因為這兩個都是世界上最偉大的博物館之ㄧ, 臺北故宮在1960被世人稱為世界4大博物館(有人稱為5大, 因為考量冬宮多為18世紀以後文物, 古代文物遠不如臺北故宮因此難以比較), 而北京故宮被稱為是世界上最重要的世界文化遺產之ㄧ。羅浮宮, 大英博物館, 大都會博物館都是從其他國家掠奪文物, 而館藏文物多非自己國家文物的非單壹式博物館。但是北京故宮與臺北故宮卻是全世界公認第壹(實在難分軒輊)的單壹式的博物館。都是世界級最偉大的博物館之ㄧ。