宋朝趙普的《秘藏通玄變化六陰洞微遁甲真經》中對此有詳細的記載：昔蚩尤作亂，皇帝頻戰不克，帝曰：“聞伏羲治天下無兵，今蚩尤壹庶人，生妖氣，伐了無功，戰而不克，吾之過矣。”忽目前五色雲從天空而下，雲中有玉女持書，出二童曰：“奉九天玄女聖命，送《遁甲符經》三卷，告以伐之，願傳。此文乃天地禍福，是八卦之吉兇，辨風雲之變動，識氣候之成敗，觀日月之盈虧，論陰陽之順逆，曉星辰之休咎，知人情之勝負。此術乃萬變萬化之法也。”帝乃長跪而受之。帝遂開函，得《陰符經》三卷。上卷乃神仙煉丹抱壹之術，說長生之法；中卷安邦定國，撫安民之法；下卷論戰伐之事。遁甲者，乃玄女之法。帝得之，而設壇造印、劍、令依次，戰蚩尤於逐鹿之野，而後厥勝。
奇門遁甲傳至周朝時，姜太公將之刪成七十二局，後至漢代黃石公傳於張良，張良又把它精簡變成了壹十八局（陽遁九局和陰遁九局），也就是現在我們看到的奇門遁甲。