壹、1999年起該全書在臺灣以雍正銅字版（書藏故宮博物館）為藍本制作電子化版本（由東吳大學中文系負責）出售。而相關書籍與研究論集亦隨之出版，如2001年11月出版之《古今圖書集成研究》、2006年11月出版之《古今圖書集成圖集》 。完整版（文字+插圖）***16萬美元，此外可分匯編購買使用權。
二、廣西大學掃描網絡索引版。由廣西大學古籍所“古今圖書集成課題組”建設而成。網站所擁有的全書圖像來自對1934年中華書局武英殿本影印本的掃描，本站所使用的索引自1984年開始編制《古今圖書集成索引》起，經歷了油印本（1984年，80萬字，三大本）、印刷本（1988年，275萬字，中華書局和巴蜀書社出版）、電子版1.0版（1998年，1200萬字，金海灣電子音像出版社和廣西師範大學出版社聯合出版）、電子版2.0版（2007年，3800萬，光盤版，待出版；2009年網絡版）等四個階段。索引數據不斷擴充完善。
此索引曾獲得諸多榮譽：印刷版曾獲國家教委第壹屆人文社會科學二等獎和廣西壯族自治區社科壹等獎、中國索引學會特等獎等多項大獎。電子版1.0版被國家新聞出版總署列為“九五”國家重點電子出版物和建國50周年獻禮項目，獲得專家好評。
網絡版是在光盤2.0版基礎上，增訂而成的。使用了52個索引數據庫，合計1189013條記録，***38359673字，是當今最大的古籍索引數據庫。