朱熹著述甚多，有《四書集註》《太極圖說解》《通書解說》《周易讀本》《楚詞集註》，後人輯有《朱子大全》《朱子集語象》等。其中《四書集註》成為欽定的教科書和科舉考試的標準。
朱子現存著作***25種，600余卷，總字數在2000萬字左右。主要有《周易本義》《啟蒙》《蓍卦考誤》《詩集傳》《大學中庸章句》《四書或問》《論語集註》《孟子集註》《太極圖說解》《通書解》《西銘解》《楚辭集註辨正》《韓文考異》《參同契考異》《中庸輯略》《孝經刊誤》《小學書》《通鑒綱目》《宋名臣言行錄》《家禮》《近思錄》《河南程氏遺書》《伊洛淵源錄》等。《文集》壹百卷，《續集》十壹卷，《別集》十卷，閡人輯錄的《朱子語類》壹百四十卷
清康熙稱朱熹：集大成而緒千百年絕傳之學，開愚蒙而立億萬世壹定之歸。[21]
朱熹學生黃囗在（《朱子行狀》）：道之正統，待人而傳……由孟子而後，周、程、張子繼其絕，至先生而始著。
南宋詞人辛棄疾：所不朽者，垂萬世名。孰謂公死，凜凜猶生。
南宋詞人陸遊：某有捐百身起九原之心，有傾長河註東海之淚。路修齒耄，神往形留。公歿不亡，尚其來享。[3]
清初江藩：晦翁是宗孔嗣孟，集諸儒之大成者也。[10]
鳳凰網（《理學大師：朱熹》）：作為壹位博學多識的大學問家，朱熹有很多方面值得後人學習。他壹生學而不厭，誨人不倦，博覽經史，治學嚴謹，著作宏富。他在訓詁、考證、註釋古籍，整理文獻資料等方面都取得了豐富的成果。另外，他對天文、地理、律歷等許多自然科學，也都進行過廣泛的研究。他作為封建社會的壹位官員，他在努力維護那個制度的同時，也能體察民情，反對橫征暴斂與為富不仁者，敢於同貪官汙吏和地方豪紳的不法行為作鬥爭。在地方官的任期內，朱熹也做了壹些如賑濟災荒、鼓勵生產等安定民生的有益工作，在封建社會的官員中，不失為壹位正直有為的人。最後還應指出，朱熹還是中國教育史上的著名教育家之壹。[10]
宋人黃震《黃氏日抄》雲：晦庵為《集註》，復祖詁訓，先明字義，使本文坦然易知，而後……發其指要。[22]
英國科技史家李約瑟（《李約瑟文集》）：朱熹是壹位深入觀察各種自然現象的自然學家[23] 。
清人全祖望（《宋元學案．晦翁學案》）：致廣大，盡精微，綜羅百代矣。江西之學，浙東永嘉之學，非不岸然，而終不能諱其偏。
英國現代生物學家李約瑟：①當我們進壹步考察這壹精心表達的自然體系時，我們不能不承認宋代哲學家所研究的概念和近代科學上所用的某些概念並無不同。②至少理學的世界觀和自然科學的觀點極其壹致，這壹點是不可能有疑問的。③宋代理學本質上是科學性的，伴隨而來的是純粹科學和應用科學本身的各種活動的史無前例的繁盛