同治年間，同治帝準備修復圓明園，供慈禧太後居住。曾試圖擇要重修。當時擬修範圍為20余處***3000多間殿宇，主要集中在圓明園前朝區、後湖區和西部、北部壹帶，以及萬春園宮門區、敷春堂口清夏堂等處。
1900年，八國聯 軍侵占北京，西郊諸園再遭劫掠，圓明園的建築和古樹名木遭到徹底毀滅。
清朝滅亡後，圓明園的遺物又長期遭到官僚、軍閥、奸商巧取豪奪，民國初期走馬燈壹樣更叠的軍閥都把圓明園作為取之不盡的建築材料場。此外，也有壹部分圓明園遺物被安放於公***場所，如長春園門銅麒麟、安佑宮丹陛石、水木明瑟碑先後於1910年至1937年被移往頤和園；安佑宮華表、石麒麟、西洋樓線法橋和翻尾石魚、梅石碑、蒔花碑、文源閣碑被分別移至燕京大學和北京圖書館舊館；蘭亭碑和“青蓮朵”等珍貴太湖石於1915年移往中山公園；長春園大東門石獅子及基座移至正陽門和新華門。西洋樓遺址的漢白玉及磚瓦也多被軍閥官僚運走，或被各家石作坊買去，就地改刻為其他石料。徐世昌拆走圓明園屬鳴春園與鏡春園的木材，王懷慶拆毀園中安佑宮大墻及西洋樓石料。1928年大水法遺址石料被拆走修建綏遠陣亡將士碑。溥儀時期的檔案留下了不少記錄：“軍人押車每日10余大車拉運園中太湖石。”實際上，拆賣的情況遠比檔案中記載的嚴重得多。從此，圓明園廢墟凡能作建築材料的東西，從地面的方磚、屋瓦、墻磚、石條，及地下的木釘、木樁、銅管道等全被搜羅幹凈，斷斷續續拉了20多年。後人稱此為圓明園火劫之後的“石劫”。
至此，圓明園已經過了火劫、木劫和石劫，圓明園建築、林木、磚石皆已蕩然無存。圓明園這處在清初盛世歷經150余年苦心經營的湖山之勝面目全非。
圓明園大水法
2002年12月13日，北京圓明園正覺寺修繕工程正式招標。正覺寺曾是清代皇室成員的禦用佛寺，由於地處綺春園墻外，才成為英法聯 軍火燒圓明園時唯壹幸免的古建築。此次修繕的範圍包括山門、文殊亭、東西五佛殿、東西配殿、西轉角房等，修繕面積***計990平方米。