1、資金不足。古籍保護需要大量資金進行，包括古籍修復、數字化保存等多個環節。但是由於預算限制或者其他原因，許多機構無法投入足夠的資金來保護古籍。
2、專業人才不足。古籍保護需要具備相關專業知識和技能的人才進行，如古籍修復師、文物鑒定師等。但是由於行業發展不足，許多機構無法招聘到合適的專業人才。