孔子是商朝開國君主商湯的後代，是商朝的宗室。武王伐紂，建立周朝，為安撫商朝的貴族，封於亳，國號宋，即宋國，所以是殷商的貴族後裔。
三監之亂後，周公以周成王之命封商紂王的庶兄、商朝忠正的名臣微子啟於宋國，死後葬於宋國故地(今商丘市睢陽區)，建有微子祠。 微子啟死後，其弟微仲即位。
微仲去世後，子宋公稽繼立;宋公稽去世後，子丁公申繼立。宋丁公去世後，子湣公***繼立。宋湣公去世後，弟煬公熙自立，太子弗父何不得立。於是弗父何之弟公子鮒祀殺煬公，欲立弗父何，弗父何拒之，於是公子鮒祀成為國君，是為宋厲公。弗父何成為正卿。
弗父何死，子宋父周立;宋父周死，世子勝繼立，世子勝生正考父。正考父事宋國戴、武、宣三位國君，以恭敬著稱，“壹命而僂，二命而傴，三命俯“。正考父嘗朝周，取回《商頌》，進行了壹些整理補充了在宋國已經亡失的篇章。
正考父死，子孔父嘉繼立。孔父嘉事宋穆公。穆公臨死前，不立己子公子馮，而立兄子公子與夷，以報兄長宣公讓國之恩。去世前遺命孔父嘉輔佐與夷(宋殤公)。孔父嘉事殤公與夷，屢次對鄭、衛等國作戰，但多以失敗告終，引起國人不滿。孔父嘉有妻十分貌美，引起另壹主政大夫華父督的垂涎。於是華父督借國人不滿，發動兵變，殺掉了孔父嘉與宋殤公。孔父嘉之子木金父逃到魯國，從此孔家成為魯國人。
木金父生祈父睪夷，祈父生孔防叔，孔防叔生伯夏，伯夏生叔梁紇，叔梁紇是為孔子的父親，是魯國著名的武士。前563年晉國荀瑩率十壹國聯軍進攻小國逼陽(今山東棗莊市中區)，逼陽詐降，聯軍入城後即降下城門準備襲擊聯軍，而此時叔梁紇則進前托住城門，使聯軍安然退出逼陽。孟獻子稱贊他：“《詩》所謂‘有力如虎’者也”。
聖人降世
叔梁紇正妻施氏，生九女而無子，妾生長子孟皮，但孟皮有足疾，不能為嗣，於是叔梁紇求於顏氏。顏氏有三女，且欲與叔梁紇為婚，但又念叔梁年老且性情急躁，於是征求三個女兒的意見。兩長女皆不願，唯小女顏征在願嫁叔梁紇。
顏征在時年十八，而叔梁紇已經七十二歲，年齡相差懸殊，兩人為婚於《周禮》不合，夫妻在尼山居住並且懷孕，故謂之“野合”。魯襄公二十二年(前551年)八月孔子降生。孔子生而頭上圩頂，而又因其母曾禱於尼山，故名“丘”。
早年生活
孔子三歲的時候，叔梁紇病逝，葬於防。叔梁紇死後，顏征在失去庇佑，為叔梁紇正妻施氏所逐，於是帶孔子庶兄孟皮與孔子至曲埠闕裏，過著清貧的生活。孔子長大後，亦不得不為生活做許多粗活。孔子後來曾說：“吾少也賤，故多能鄙事。”
雖然家庭貧困，但孔子仍然勤奮好學。幼年的孔子常將祭祀用的禮器(俎豆)擺設起來，練習行禮演禮，作為壹種遊戲。孔子長成後，身高九尺有六寸，因此鄉人稱其為“長人”。季氏曾饗士，孔子也前去，但為季氏家臣陽虎所絀，於是孔子返回。
政治生涯
孔子自20多歲起，就想走仕途，所以對天下大事非常關註，經常思考治理國家的諸多問題，也常發表壹些見解，到30歲時，已有些名氣。
魯昭公二十年，齊景公出訪魯國時召見了孔子，與他討論秦穆公稱霸的問題，孔子由此結識了齊景公。魯昭公25年，魯國發生內亂，魯昭公被迫逃往齊國，孔子也離開魯國，到了齊國，受到齊景公的賞識和厚待，甚至曾準備把尼溪壹帶的田地封給孔子，但被大夫晏嬰阻。
魯昭公27年，齊國的大夫想加害孔子，孔子聽說後向齊景公求救，齊景公說：“吾老矣，弗能用也。”孔子只好倉皇逃回魯國。當時的魯國，政權實際掌握在大夫的家臣手中，被稱為“陪臣執國政”，因此孔子雖有過兩次從政機會，卻都放棄了，直到魯定公9年被任命為中都宰，此時孔子已 51歲了。
孔子治理中都(今汶上縣)壹年，卓有政績，被升為小司空，不久又升為大司寇，攝相事，魯國大治。魯定公12年，孔子為削弱三桓(季孫氏、叔孫氏、孟孫氏三家世卿，因為是魯桓公的三個兒子的後代，故稱三桓，當時的魯國政權實際掌握在他們手中，而三桓的壹些家臣又在不同程度上控制著三桓，采取了隳(hui，音輝)三都的措施(即拆毀三桓所建城堡)。後來隳三都的行動半途而廢，孔子與三桓的矛盾也隨之暴露。
魯定公13年，齊國送80名美女到魯國，季孫氏接受了女樂，君臣迷戀歌舞，多日不理朝政，孔子非常失望，不久魯國舉行郊祭，祭祀後按慣例送祭肉給大夫們時並沒有送給孔子，這表明季氏不想再任用他了，孔子在不得已的情況下離開魯國，到外國去尋找出路，開始了周遊列國的旅程，這壹年，孔子55歲。
駕鶴西去
這段期間孔子專註於教育和古籍整理。哀公十二年冬，孔鯉先孔子而死。哀公十四年，顏回先他而去。孔子有所感慨：“昔從我於陳蔡者，皆不及門也。”哀公十四年夏，齊國陳恒弒其君，孔子齋戒沐浴三天，向哀公懇請伐齊，哀公讓他“告季孫”，孔子又向季孫請求出兵，結果遭到拒絕。
前480年，孔子另壹得意門生子路死於衛國內亂，而且還被剁成肉醬。經過壹這系列打擊後，孔子知道自己時日不多。
前479年的壹天，子貢來見孔子，孔子柱杖依於門前遙遙相望。他對子貢說：“賜，妳自怎麽來得這麽晚?”於是嘆息道：“太山(即泰山)壞乎!梁柱摧乎!哲人萎乎!”說完，流下眼淚。接著他又對子貢說：“夏人殯於東階，周人殯於西階，殷人殯於兩柱間。我昨晚夢到奠於兩柱之間。我是殷人。”
七天後，孔子逝世，終年七十三歲，被葬於曲阜城北的泗水岸邊。眾弟子為其服喪3年，子貢為孔子守墳6年