大量綜合性匯編叢書仍在近代古籍叢書中占顯要地位，著名的有：劉承幹的《嘉業堂叢書》、張鈞衡的《適園叢書》、董康的《誦芬室叢刊》、陶湘的《托跋廛叢刻》、繆荃孫的《雲自在龕叢書》、鄧實的《古學匯刊》、《風雨樓叢書》、鄭振鐸的《玄覽堂叢書》、趙詒琛的《峭帆樓叢書》、《又滿樓叢書》、鄭國勛的《龍溪精舍叢書》及羅振玉在宣統至民國間為保存敦煌文獻所刊刻的《敦煌石室遺書》、《鳴沙石室佚書》等。影響最為深遠、至今仍為學術界普遍重視的，應屆《四部叢刊》、《四部備要》、《叢書集成初編》三大古籍叢書。