1、對比總建築面積，國家博物館總建築面積為20萬平方米，是世界上單體建築面積最大的博物館，而南京博物院占地13萬余平方米。
2、對比藏品數量，國家博物館藏品數量有40萬件，包括古代文物、近現代文物、圖書古籍善本、藝術品等多種門類。其中，古代文物戴品81.5萬套，也是中華文物收藏量最豐富的博物館之壹，而南京博物院擁有各類藏品432768件，珍貴文物371032件，珍貴文物數量居中國第二。
3、中國國家博物館簡稱國博，位於北京市中心天安門廣場東側，是代表國家收藏、研究、展示、闡釋中華文化代表性物證的最高歷史文化藝術殿堂，負有留存民族集體記憶、傳承國家文化基因、促進文明交流互鑒的重要使命，也是國家文化客廳，而南京博物院位於江蘇省南京市玄武區中山東路321號，是中國三大博物館之壹，簡稱南院或南博，其前身是民國二十二年是蔡元培等倡建的國立中央博物院，是中國創建最早的博物館、中國第壹座由國家投資興建的大型綜合類博物館。現為大型綜合性的國家級博物館、首批中央地方***建國家級博物館、國家4A級旅遊景區、全國重點文物保護單位和中國20世紀建築遺產。