清代校勘學著作是《十三經註疏校勘記》。
《十三經註疏校勘記》的校勘，以所據版本豐富著稱。《十三經註疏校勘記》，清阮元(1764—1849)撰。此書為十三部儒家經典的總註釋，收“儀禮”四十四卷，《周禮》二十八卷，《孟子》十四卷，《周禮》二十九至四十二卷，《周易》九卷，《毛詩》二十二卷，《禮記》二十七卷。
《左傳》六十卷，《谷梁》二十卷，《毛詩》十壹卷，《書經》二十卷，《公羊》二十八卷。此本煌煌壹百五十冊，品相絕佳，實屬難得。
《十三經註疏校勘記》於嘉慶十三年由阮元文選樓刊刻單行（今《續修四庫全書》即影印該本），嘉慶二十壹年江西府學重刊《十三經註疏》，盧宣旬摘錄《校勘記》附在《註疏》本的後面，因單行本底本系用毛本，導致時有不合，且盧氏去取亦不精。
道光九年刊刻《皇清經解》，主事者將單行本悉數收錄重刻，並明言對《註疏》摘抄本的不滿，認為沒有達到阮元的本意。《皇清經解》後又有鹹豐補刊本。
《十三經註疏校勘記》評價
阮元“雖為達官，不廢問學，於經史、小學、天算、輿地、金石、校勘，皆造其微，而又長於治經，具言訓詁，得之王念孫、而闡明義理，又與焦循相近”(《清人文集別錄》卷十壹)。壹生重視提倡文化，培養人才，對清代學術文化的發展有較大的貢獻。
阮元在校勘方面所做的工作，主要是主持纂修《十三經註疏校勘記》，每部經書，都由壹名學者校勘。
《周易》元和李銳校，《尚書》德清徐養原校，《毛詩》元和顧廣圻校，《周禮》武進臧庸校．《儀禮》德情徐養原校，《禮記》臨海洪震煊校，《春秋左氏傳》錢塘嚴傑校，《春秋公羊傳》武進臧庸校，《春秋榖梁傳》元和李銳校，《論語》仁和孫同元校，《孝經》錢塘嚴傑校，《爾雅》武進臧庸校，《孟子》元和李銳校。
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