當初的倭寇只是九州沿海地區有名的船主、官員和無業人員。14世紀初,日本進入南北朝分裂時期,戰敗的南方封建主組織武士對中朝沿海地區進行掠奪。
清末,在光緒皇帝的聖旨中,“倭寇”被廣泛用於指代日軍,並衍生出“倭寇軍、倭寇兵、倭寇炮、倭寇庭”等詞語。
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日軍入侵不僅導致沿海地區城鎮衰落,還造成其他地區丁莊“停耕廢織,莊稼失時”,給中國人民的生命財產造成了巨大損失。
從嘉靖三十壹年(1552)到嘉靖四十三年(1564),嘉靖日本叛亂基本結束,對浙江、江蘇、福建、廣東等東南沿海地區造成毀滅性破壞。倭寇“突破浙東、杭州、鎮、淮、陽至南通,沿江各郡不下百余。
倭寇在倭亂期間兇猛的戰鬥力和精良的武器也使明軍易受其攻擊,這不僅提振了倭寇戰勝明軍的信心,也進壹步強化了倭寇在倭亂期間的恐慌心理。