1952更名為東北人民大學圖書館。
1958更名為吉林大學圖書館。
2000年6月，原吉林大學、吉林工業大學、白求恩醫科大學、長春理工大學、長春郵電大學合並組建新的吉林大學，原五所大學的圖書館也進行了合並。
聯合辦學後，吉林大學圖書館設有中心圖書館、工程圖書館、醫學圖書館、地學圖書館和信息學圖書館。
2004年，原解放軍軍需大學並入吉林大學。其農業系圖書館雖然管理體制不同，但與學校圖書館建立了密切的合作關系。