主要區別是，性質不同、主要成分不同、特點與應用不同，具體如下：
壹、性質不同
1、人參酵素
人參酵素是以人參為原料再植入有益菌發酵而來。
2、酵素
酵素是以動物、植物、菌類等為原料，添加或不添加輔料，經微生物發酵制得的含有特定生物活性成分（包括多糖類、寡糖類、蛋白質及多肽、氨基酸類、維生素類）的產品。
二、主要成分不同
1、人參酵素
人參為五加科多年生草本植物，人參的主要活性成分為人參皂苷。皂苷是人參的主要活性物質，具有極強的生理活性，可以通過提高稀有皂苷含量來提高人參酵素的價值。?
2、酵素
主要營養成分是維生素，多糖類，寡糖類，蛋白質及多肽，氨基酸類等。
三、特點與應用不同
1、人參酵素
人參作為中國傳統的美容護膚佳品，是使用最為廣泛的植物化妝品原料? 。人參皂苷具有抗光氧化、抗皮膚衰老、清除自由基等作用，可有效防止皮膚的光老化。?
2、酵素
（1）、環保酵素的應用
酵素可在壹定程度上抑制有害微生物的生長和繁殖，尤其可對病原菌和腐敗細菌的生命活動，具有明顯實用價值。
（2）、酵素菌肥在種植業上的應用
由於多年來農藥和化肥的泛濫使用，我國種植土壤的土壤板結、通透性降低、土壤養分流失、病蟲害猖獗等問題日漸嚴重。酵素的出現及應用為解決這些問題提供了新的研究方向。在糧食作物、蔬菜、水果等的種植上，酵素菌肥的應用均有較好的收益。?
（3）、酵素菌生物有機飼料在養殖業上的應用
相關研究表明，酵素菌發酵蛋白飼料可顯著提高雞蛋蛋白質含量，降低蛋黃膽固醇含量?[23]?；將生物酵素添加到豬飼料進行餵養，可顯著改善育肥豬的健康狀況，提高豬的平均增重，降低耗料增重比，降低飼料成本。
（4）、酵素在日化領域的應用
酵素化妝品是包括酶以及產酶微生物和相關調節因子的壹類生物制品，在美白祛斑、脫屑、祛痘、防曬、抗衰老、抗菌等方面發揮多重功效。
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