中國中醫科學院眼科醫院有關眼科的科室設置：
眼科：眼科特需門診、消渴目病科、目系眼病科、內障眼病1科、圓翳內障科、內障眼病2科、屈光手術科、眼表疾病科、針灸科、視光科、眼整形科、國際會診中心。
醫技、醫輔科室：視功能檢查科。