馬姓由來和起源有很多，比較常見的說法有：出自嬴姓、源於官位、源於少數民族改姓。
1、出自嬴姓
出自帝顓頊裔孫伯益之後趙奢的封地馬服，屬於以居邑名為氏。舜帝時候，伯益因幫禹治水有功，又為舜馴服鳥獸，被舜賜姓嬴氏，嬴姓出現，舜把自己的姚姓的女兒嫁給他。
2、源於官位
自春秋時期楚國官吏巫馬，屬於以官職稱謂為氏。巫馬，是春秋時期楚國設置的壹種官位，專門負責給馬匹治病。古代，巫、醫同義，因此稱巫馬。
3、源於少數民族改姓
源於回族，屬於文化上漢化改姓為姓，回族中馬姓主要與阿拉伯、波斯人名的音譯，特別是與伊斯蘭教創始人穆罕默德的音譯有關，因為馬與穆諧音，所以古籍許多著述中都將穆罕默德譯作馬哈麻。
馬姓的遷徙傳播
馬氏是壹個典型的多民族、多源流姓氏，在當今姓氏排行榜上名列第十四位，人口約1846.1萬，占全國人口總數的1.15%左右。
漢族馬姓最初發祥於春秋戰國時代的河北省邯鄲市壹帶。在戰國末期，馬姓子孫就已有壹些遷居陜西省關中，在此後的時期內，馬姓不斷得以發展，並且有許多成為當朝高官。家族逐漸得以興旺，並且最終使扶風茂陵（今陜西省興平市茂陵）成為馬氏的發展繁衍中心。
兩漢至南北朝時期，馬姓除在扶風茂陵成為望族外，還分布於今河南、河北、山東、湖北、四川、甘肅、江蘇、浙江等省的壹些地方，同時漢代時期，馬姓宗族大舉西遷到西北地區，後來再度東遷到黃淮地區。