今海內外留下的《明實錄》各種傳抄本約十余部，已有兩種影印本問世：壹是1941年梁鴻誌所影印的南京國學圖書館所藏抄本（簡稱“梁本”），***五百冊。二是臺灣中央研究院歷史語言研究所1962年在臺灣影印的原北平圖書館所藏“紅格本”，除正文外又附校勘記二十九冊，以及《崇禎實錄》、《崇禎長編》、《皇明寶訓》等二十壹冊，全部計壹百八十三冊。兩種影印本中，某些實錄的卷數有所不同。 1941年，梁鴻誌影印江蘇省立國學圖書館傳抄本，將建文朝史事附入《成祖實錄》，並附後人補輯的《崇禎實錄》十七卷，計五百冊，為其後通用本，但錯訛甚多。這是中國《明實錄》的第壹部印刷本，在此之前所流行之本皆是鈔本。
從1930年始至1961年止，中央研究院歷史語言研究所對國立北平圖書館（今中國國家圖書館）所藏的紅格鈔本《明實錄》進行的大規模整理和校勘。此次整理和校勘，以紅格本為底本，以廣方言館、抱經樓本、北京大學本、禮王府本、嘉業堂本、天壹閣本、明內閣精寫本、梁鴻誌影印本、內閣大庫藏清初明史館鈔本等數十種本子為對校本，對《明實錄》中的錯訛 進行了長時間大規模的校勘，先後有傅斯年、王崇武、黃彰健等專家參加，凝結了幾代人的心血。此次整理和校勘的結果是影印了經過校勘的本子－－臺本，和撰成了具有相當分量的《明實錄校勘記》。全書計正文壹百三十三冊、校勘記二十九冊、附錄二十壹冊，是為目前最善與最通行之傳本。 明朝每修完壹代皇帝實錄都會妥善保管，尤其是明神宗以後，實錄與寶訓（寶訓與實錄同時修，並同時進呈皇帝）修完後，即謄寫四份，實錄與寶訓正本藏皇史宬，副本藏內閣，大本藏乾清宮，另有小型本以供禦覽。這樣，就有正副大小四種本子同時並存，但其內容完全壹樣，不得有任何錯漏。李自成進京後，四種實錄都受到不同程度的損破，但正副大小四種實錄絕大部分尚完好無損。清初為修明史，遂將正副大小四本俱移藏明史館。為便於檢閱，明史館綜合四種本子的明實錄重新抄錄壹本，力求完善，以供修史之用。乾隆年間，因《明史》修成，而實錄又殘缺，遂從大學士三寶之請，於乾隆四十八年（1783年）三月，將庫存《明實錄》及《皇明寶訓》***4757本，移出史館壹並焚毀。此後，就只有明史館傳鈔的那部實錄為最善之本了。而隨著歲月的流逝，這部實錄亦日漸殘破。民國年間，實錄藏於北平圖書館中，稱為紅格鈔本，其後經過輾轉遷移，現在則藏於國立故宮博物院圖書文獻館。