耿鑒庭先生應診之余，於文史方面涉獵頗廣。在目錄學、訓詁學、金石學、古器物學、文物考古方面均有相當研究。對揚州文獻、文物的搜集、保護不遺余力。其中，尤對醫藥文獻、醫藥文物更加註意，對中醫古籍文獻的整理也做出重要貢獻。他以中醫研究院創建時所集的中醫古籍為基礎，發起與北京圖書館協作，把全國60多家圖書館珍藏的中醫書，編成全國第壹部《全國中醫圖書聯合目錄》，作為國慶十周年獻禮。特別是他在改革開放以後還主編了《廣陵醫籍叢刊》，遍收揚州醫家及流寓揚州的外籍醫家著作的各種刻本與稿本，在每項著作前都加入題跋及序，使揚州地方中醫典籍的特點及成就得以宏揚，從而開中醫地方典籍出版之先河，豐富了中醫典籍的寶庫。70年代末，經先生多方奔走，艱辛努力，在陳翰伯、王子野的支持下，成立了中醫古籍出版社，先生任副社長兼總編輯，為中醫古籍整理出版作了大量工作，從而使中醫孤、善本的搜集整理編纂工作走上專業化、系統化的道路。