1、成分不同
瑪瑙：主要成分為二氧化矽，由於與水化二氧化矽（矽酸）交替而常重復成層。因其夾雜氧化金屬，顏色可從極淡色以至暗色。用鐵、鈷、鎳等鹽類，任它們自然滲透於矽酸凝膠中，能人工制成"瑪瑙"，天然瑪瑙可能亦是在相似情形下生成的。
玻璃：它的主要成分為二氧化矽和其他氧化物。 普通玻璃的化學組成是Na2SiO3、CaSiO3、SiO2或Na2O·CaO·6SiO2等，主要成分是矽酸鹽復鹽，是壹種無規則結構的非晶態固體。
2、用途不同
瑪瑙：常用作玩物、觀賞物、飾物或玩賞物。種類繁多，素有“千樣瑪瑙萬種玉”之說，除水膽瑪瑙最為珍貴外，壹般以搭配和諧的俏色原料為佳品。
玻璃：廣泛應用於建築物，用來隔風透光，屬於混合物。另有混入了某些金屬的氧化物或者鹽類而顯現出顏色的有色玻璃，和通過物理或者化學的方法制得的鋼化玻璃等。
3、保養方法不同
瑪瑙：不要碰撞硬物或是掉落，不使用時應收藏在質地柔軟的飾品盒內。要盡量避免與香水、化學劑液、肥皂或是人體汗水接觸。瑪瑙平時擺放盡量避開陽光，經常擦拭保持清潔，有條件的話偶爾用純凈水泡壹下可以補充水分，保持濕度瑪瑙會更漂亮。
玻璃：平時不要用力碰撞玻璃面，為防玻璃面刮花，最好鋪上臺布。要避免潮濕，遠離爐竈，要與酸、堿等化工試劑隔絕，防止腐蝕變質。使用保鮮膜和噴有洗滌劑的濕布也可以讓時常沾滿油汙的玻璃“重獲新生”。
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