（壹）訓詁學著作
郭慶藩深通六書訓詁，嗜古好學，精研《說文》，承乾嘉樸學余緒，於訓詁考證之學頗有見地。這方面的著作有：《莊子集釋》十卷，《莊予註釋》壹卷，《讀莊予劄記內外篇》不分卷，《說文經字正誼》四卷，《說文經字考辨證》四卷，《說文答問疏證補誼》八卷，《許書轉註說例》、《音學五書敘》合壹卷，《詩異文考證》八卷，《淮南子校註》不分卷，《合校方言》四卷。
《莊子集釋》壹書收錄了郭象註、成玄英疏和陸德明音義的全文，摘引了清代學者王念孫、王引之、俞樾、李楨等人的訓詁考證，盧文昭的校勘，並附有郭嵩燾及郭慶藩自己的校釋成果。
《莊子註釋》壹卷，《讀莊子劄記內外篇》不分卷，這兩書的學術成果已融入《莊子集釋》壹書，以“慶藩案’’的形式出現，是郭氏研究《莊子》的訓詁考證、見解，包括從別書輯錄的司馬彪註，以補《釋文》之闕。這兩書沒有刻本，現在只有光緒年間的稿本保存。
《說文經字考辨證》四卷，光緒二十壹年（1895）岵瞻堂郭氏維揚刻本，《續修四庫全書》收錄，據光緒二十壹年刻本影印。是書成完成於光緒十八年（1892）。郭慶藩認為錢大昕《潛研堂說文答問》考證精審但不夠完備，而陳壽祺《說文經字考》雖能補錢氏之未備，然而“或以或體為正體，或以古籀文為為正字，或據漢儒壹家之說改易正字，皆未免務為奇嗣”，故而對陳氏書逐字註釋考辨，其可從者進行疏證，不可從者詳釋字義並駁正謬誤。
《說文經字正誼》四卷，光緒二十年（1894）湘陰郭氏揚州刻本。郭慶藩認為陳壽祺《說文經字考》雖然可補錢大昕之闕，但是“間涉淺易之處，又闕其所不當略者”，於是博采諸儒訓詁，反復更訂，逐字詳釋。該書二百壹十七字，遵許書正誼之例，能集諸家所長而考證其得失，援引頗為詳備，凡易經、書經為壹卷，詩經為壹卷，春秋、左傳、公羊、禮記、周禮、儀禮為壹卷，論語、孟子、爾雅為壹卷。
《合校方言》十三卷，又稱《方言校證合刊》，光緒十七年（1891）思賢講社刻本，《古書叢刊》收錄，據思賢講社刻本影印。是書前有王先謙序、郭慶藩自序（王先謙代）、盧校方言序，書後附有杭大宗《續方言》、程際盛《續方言補》。全書取戴震、盧文弨兩家校本合刊，於郭璞註下先列戴震考證，後列盧文弨校勘，最後附有慶藩案語。
《許書轉註說例》、《音學五書敘》合壹卷，光緒十壹年（1885）岵瞻堂刻本。
《淮南予校註》不分卷，劉安撰、高誘註、郭慶藩纂訓，清稿本。
《詩異文考證》八卷，稿本。
（二）文學著作
文學方面，湘陰郭氏私淑桐城壹派，劉聲木在《桐城文學淵源考》中，將郭嵩燾、郭岜燾等歸入“私淑桐城文學諸人”壹類，說郭嵩燾“與曾國藩、劉蓉、吳敏樹相友善，以文字相切摩，研貫經史，尤速於‘禮’”。郭慶藩承其家學，於古代詩詞頗有造詣，“習聞其父與叔論文之旨，亦工詩、古詩詞，其論文剖析源流，開抉閫奧，鶩精詣微”。
這方面的著作有：《十二梅花書屋詩集》六卷，《讀書秋樹根圖題詠》不分卷，《岵瞻堂詩義叢鈔》不分卷，《廣陵酬唱集》壹卷，《岵瞻詩草》壹卷，《敬齋詩稿》不分卷，《泊然盦文集》二卷，《遊園剩稿》二卷。
《十二梅花書屋詩集》六卷，光緒十五年（1889）郭氏泊然盦刻本。此詩集以年為序編次，首數卷為少時所作，“格律未嫻，語多拙澀，而古體尤甚”，斜末二卷為中年以後之作，“篇幅漸老，而七古尤有淋漓酣暢之致”。徐世昌輯《晚晴簃詩匯》，收錄《十二梅花書屋詩集》詩三首：《野望》、《新霽》、《將之日本，奉別張雨珊司馬即送其之山東》，其中《新霽》入選今人陳友琴選註<千首清人絕句》。曾卓編《湘雅摭殘》，收錄《潦園》、《寄懷馮筱亭兼訊江予愚昆仲》兩詩。
《讀書秋樹根圖題詠》不分卷，光緒八年（1882）湘陰郭氏刻本，《中國古籍善本書目》著錄。是書前有善化李楨序、湘鄉左楨序、長沙陳耀序，後有長沙李壽榕跋，湘陰郭嵩燾跋。郭慶藩取杜甫詩句“讀書秋樹根”，繪成壹圖，以示本人向學之誌，並征引當時學界名流詩文，纂集成冊，是為此書。
《岵瞻堂詩義叢鈔》不分卷，清抄本。
《廣陵酬唱集》壹卷，光緒二十年（1894）年揚州刻本。
《岵瞻詩革》壹卷，稿本。
《敬齋詩稿》不分卷，稿本，《中國古籍善本書目》著錄。
（三）其他
《□賢書劄》不分卷，又稱《□賢手劄》、《名賢手劄》、《鹹同中興名賢手劄》，光緒十年（1884）湘陰郭氏岵瞻堂刻本，光緒十壹年（1885）上海同文書局石印本，民國十四年（1925）上海掃葉山房石印本，民國十二年（1923）上海東萊書局石印本，入選《近代中國史料叢刊》，據光緒十年刻本影印。郭慶藩居父喪期間，輯刻其父郭岜燾所收到的當時名賢函件，匯集成冊。八賢指曾國藩、胡林翼、左宗棠、曾國荃、彭玉麟、沈葆楨、李鴻章和駱秉璋。
《明人墨跡》，光緒八年（1882）湘陰郭氏十二梅花書屋刻石，清光緒拓本。
《郭岜燾行述》壹卷，又稱《先府君郭公行述》，光緒八年（1882）刻本，《續修四庫全書》收錄，附於郭岜燾《雲臥山莊詩文集》卷末，據光緒八年湘陰郭氏岵瞻堂刻本影印，《中國古籍善本書目》著錄。
《岵瞻堂自語》不分卷，稿本。
《教學要術》十二卷，稿本。