題解
《本草綱目》***52卷，載藥1892種（其中李時珍新增藥物374種），書中附有藥物圖1109幅，方劑11096首（其中8000余首是李時珍自己收集和擬定的），約190萬字，分為16部、60類。每種藥物分列釋名（確定名稱）、集解（敘述產地）、正誤（更正過去文獻的錯誤）、修治（炮制方法）、氣味、主治、發明（前三項指分析藥物的功能）、附方（收集民間流傳的藥方）等項。全書收錄植物藥有881種，附錄61種，***942種，再加上具名未用植物153種，***計1095種，占全部藥物總數的58%。李時珍把植物分為草部、谷部、菜部、果部、本部五部，又把草部分為山草、芳草、溼草、毒草、蔓草、水草、石草、苔草、雜草等九類。
體例
《本草綱目》改進了中國傳統的分類方法，格式比較統壹，敘述也比較科學和精密，例如：把廣義的“蟲”藥擴充到106種，其中昆蟲藥為73種，分為“卵生”、“化生”和“濕生”三類。對動物和植物的分類學的發展具有很大意義。
《本草綱目》糾正了前人的許多錯誤之處，如南星與虎掌，本來是同壹種藥物，過去卻誤認為兩種藥物；以前葳蕤、女萎認為是同藥，李氏經過鑒別則確認為兩種；蘇頌在《圖經本草》將天花、括樓分為兩處，其實是同壹種植物；前人誤認“馬精入地變為鎖陽”、“草子可以變魚”，壹壹予以糾正之。並且在本書中還加入了許多新的藥物。對某些藥物的療效，李時珍還通過自己的經驗作了進壹步的描述。本書還載敘了大量寶貴的醫學資料，除去大量附方、驗方及治驗病案外，還有壹些有用的醫學史料。
本書不僅是壹部藥物學著作，還是壹部具有世界性影響的博物學著作，書中涉及的內容極為廣泛，在生物、化學、天文、地理、地質、采礦乃至於歷史方面都有壹定的貢獻。
《本草綱目》乃是壹部集十六世紀以前中國本草學大成的著作,書中所收集的資料廣博，「上至墳典，下至傳奇，凡有相關，靡不收集」，因此書中不免有些內容與現代的認識不符,甚至有些可能具有迷信的色彩，例如，鉛粉辛寒無毒，現代則認為有劇毒的；又如其中人部收錄的孝子衣帽、寡婦床頭灰、草鞋、男陰毛治蛇咬、女陰毛治「五淋、陰陽易病」、人魄（人吊死後的魂魄）鎮驚嚇、人肉療羸瘵（割股療親）、人中黃（人糞）治嘔血、梁上塵治昏厥等皆可入藥。這部份李時珍大多引用《輟耕錄》、《本草拾遺》的說法，采以姑妄信之「凡經人用者，皆不可遺」的態度。另外李時珍並駁斥陳藏器的《本草拾遺》，認為吃人肉療羸瘵是錯誤的。不過也正由於巨細靡遺的收錄，使得壹些已散佚的古代醫書及本草藉由綱目而保存下來。
影響
《本草綱目》先後流傳到日本（1606年）、朝鮮、越南等地，1656年，波蘭人蔔彌格（P. Michael Boym，1612年～1659年）將《本草綱目》譯成拉丁文本，書名《中國植物誌》 （Flora sinensis），在歐洲維也納出版。1676年米蘭出版了意大利文譯本，1735年以後又被翻譯成法文、德文、英文、俄文等多種文字。