按照學術理論分為五類:稷山學派、古典學派、福祿學派、但丁學派(當時的丹學派)和展顏學派。按地域分，有龍門派、嶗山派、綏山派、玉山派、華山派、廬山派、老華山派、鶴山派、霍山派、武堂派。
按人分，有邵陽派(王)、正陽派(鐘)、春陽派(、)、海禪派()、三豐派(張三豐)、撒祖派(撒守儉)、紫陽派()、五六派(吳、劉華陽)、重陽派(王忠甫)、陰Xi派。
按門分，有混派(太上老君)、南無派(譚楚瑞)、靜派(孫不二)、惠今派(齊本壽)、正壹派(張)、衛青派(馬丹陽)、天仙派(呂春陽)、玄武派(真武皇帝)、凈明派派(徐景陽)、雲陽派(張)。太乙派(蕭寶楨)、全真派(王重陽)、正壹派(張宗言)、真空派(鼓祖)、鐵關派(周祖)、日本新教派、自然主義派(張三豐)、先天派、光輝派等。
歷史上也有正壹派(張道陵)、南宗(呂純陽)、北宗(王重陽)、鎮東派(張清智)、太乙派(黃洞派)、武東派之分，以及石天道教、全真道教、靈寶道教、衛青道教之分。還有德、先天、靈寶、正、樸、明、玉堂、天心八派。
現在很多門派都在走下坡路，剩下的著名門派有北方的全真教，南方的正壹派，茅山派，嶗山派，武當派，廬山派以及港臺地區的民間道教門派。