同治元年(1862)，太平軍攻陷廣東高州，兩廣總督調丁日昌到高州協助軍務。丁日昌主張在唐嫣設立炮局，鑄造開花炮。兩年，江蘇巡撫李鴻章設立上海機器局，因丁日昌平時關註西方科技，被調去督辦。因此，我認識了郭松濤，並和他成為了親密的朋友。淮軍收復無錫後，丁日昌被保直隸州周知的稱號，並賞賜華淩，命其辦理商辦。民國三年(1864)，淮被封為常州知府。湘軍攻克南京後，丁日昌被保證當道士，留在江蘇以彌補不足。四年(1865)被封為蘇松泰道，同時主管海關。處理洋務時，與英國領事巴夏禮爭論，處理洋務，如驅逐洋兵出城，沒收非法洋船，索回吳淞口炮臺基業，廢除防衛營付給英法士兵的兵費，禁止洋涇浜收取賭規，將英國傳教士呂尚繩之以法，拔掉浦東至外商私辦川沙的電報線，將外國流氓遣送回國等。同時積極向西方購買機器，將上海機械制造局遷至今天的江南造船廠。清軍攻克福建漳州後，丁日昌不遺余力地支援軍餉和軍火，被李鴻章評價為“才華出眾”、“不避苦勞怨，操守甚嚴”，被封三等功，封三代。八月，升任淮鹽運使。當時淮河鹽政危害更大。丁日昌執政後，禁止私售，懲治貪官，稅收大增。
同治五年(1866)，揚州青龍湖下面的堤壩決口，清廷命丁日昌就近修復堤壩。折後加政治使節頭銜。次年，升任江蘇巡撫。太平天國戰爭在江蘇結束後不久，民情消退，丁日昌培植民情，鋤富扶滑，清理積案，制定月報，錢糧大作戰，清廷下令各省效仿。七年(1868)設局編刻各種牧令書籍，整理解決江蘇歷年錢草賦稅，在常熟等地興修水利。同年，曾國藩呈上《國內外海洋海軍章程》，所附《海洋海軍戰場論》提出了“專設私艦、招募駕駛員”、“沿海築堡”、“選拔訓練陸兵”、“建設三洋海軍”等建議，使“北、東南、三洋連成壹體”。曾國藩看完反應不大。直到同治十三年(1874)日軍侵占臺灣，海防的提議才得以復興，並由廣東巡撫張照東奏請，引起了清朝朝野和地方官員的重視。
第八年(1869)，丁日昌舉足輕重，主張“興人才，除虛冗，利廉俸祿，先作文士，失五谷，改武部”。九月，出省城查勘水患時，部下與人廝打，致使沂水丁死亡。丁日昌提請部裏調查，嚴懲他，並被清廷赦免。同月，與馬新貽重修江南同治。十月，丁目憂心。十二年(1873)七月，回老家安葬母親的時候，我淋濕了。
光緒元年(1875)，遊覽北京後，請病假回老家休養。清廷下令去天津幫助北洋大臣李鴻章做生意，只準四月。11月，任福建巡撫兼海運部長。次年夏天，連日暴雨，福州積水深度達到十多尺。丁日昌親自站在城墻上六天六夜，指揮救濟數十萬災民，並下令海關暫緩征收米稅，派船讓商人們向福州賣糧，使米價持平。
當時臺灣原住民多，丁日昌帶病遊臺灣，人心安定。還派兵鎮壓鳳山縣西滿社和獅頭、龜紋社的動亂，並制定條例處理善後事宜。臺灣中部的水鋪等六個俱樂部不熟悉樹藝，丁日昌命令* * *為他們工作。它還命令地方當局給土著人銀和糧食，教他們耕作方法，並建立誌願學校教他們識字。他還談到了臺灣漁民稅等雜稅，認為臺灣省如果不認真整頓，過不了幾年，日本就會出兵占領，所以他主張修建鐵路，開采礦產，用關稅等稅收來造船，增加航線。7月，他請假回老家休養，3月法院給他請假，允許他在家打球。因病難以快速康復，多次提出辭職。
光緒四年(1878)，山西、河南饑饉，人吃人。丁日昌竭力籌款，派人到臺灣省、新加波、暹羅等地募捐，共收到300多萬元。4月，清廷允許他辭職。病情稍有好轉後，他被清廷派往福州處理吳石山宗教計劃。次年，我回到家鄉；三月，授巡撫銜，受命駐守南陽，與沈葆楨等巡撫處理海防，統率南陽水師全軍。後來，他還擔任國務大臣，丁日昌很少說話，寫了16篇關於海防的文章。
光緒八年(1882)，李鴻章、丁木有辭職，任命丁日昌為直隸總督。消息傳來，丁日昌死於正月初十，享年60歲。丁日昌藏書豐富，宋元時期校勘過許多筆記。《執靜室書目》共五卷，應與《範天逸亭》、《黃柏柏宋軼集》齊名。
光緒四年(1878)，山西、河南饑饉，人吃人。丁日昌竭力籌款，派人到臺灣省、新加波、暹羅等地募捐，共收到300多萬元。4月，清廷允許他辭職。病情稍有好轉後，他被清廷派往福州處理吳石山宗教計劃。次年，我回到家鄉；三月，授巡撫銜，受命駐守南陽，與沈葆楨等巡撫處理海防，統率南陽水師全軍。後來，他還擔任國務大臣，丁日昌很少說話，寫了16篇關於海防的文章。
光緒八年(1882)，李鴻章、丁木有辭職，任命丁日昌為直隸總督。消息傳來，丁日昌死於正月初十，享年60歲。丁日昌藏書豐富，宋元時期校勘過許多筆記。《執靜室書目》共五卷，應與《範天逸亭》、《黃柏柏宋軼集》齊名。