漢代:逐漸總結出各種煉丹方法，包括大量的化學反應。典型的煉丹成果有:“丹化”(硫化汞加熱得到水銀)、“神府”(水銀和黑鉛升級轉化為氧化汞和四氧化三鉛)、“沈丹”(雄黃和雌黃混合而成，成分主要是升華的硫化砷)、“還丹”。主要成分為水銀、硫化汞、雄黃)、“煉丹”(由八月朱砂、雄黃、雌黃、曾青、石膏、膽囊、鈣礬石、磁石提煉而成，主要成分為朱砂、穿心蓮內酯)、“肉丹”(由水銀升華而成，主要成分為氧化汞)、“鐵丹”(黃軒包衣丹)
狐貍崗子，東漢中期的煉丹家。他提出了將膽結石(硫酸)和朱砂等藥物熔化，其中提到加熱硫酸銅和硫酸亞鐵可以得到壹種煙霧，這種煙霧會水化成液體，這是已知最早的制備硫酸的記錄。此外，他還提出了煉錫的灰坯爐法，將金銀礦石粉和鉛熔煉，分離出滲入金銀的鉛塊，焙燒後吹掉氧化鉛，從而提純金銀，說明金銀等金屬形成的合金已被認可。東漢魏伯陽的《周易參同契》是我國最早的煉丹術理論著作，強調“變化是真實的，總是自因的”觀點，並簡要描述了但丁的結構。書中說“白水銀為流珠”，“太陽為流珠，人常欲去”，“火在飛，塵不見”，說明我們認識到水銀是流動的，難以控制的，然後又說“死去的金花，化為白色液體，凝固為堅”，發現水銀可以和鉛形成合金。
中國最早的本草著作《神農本草經》受到煉丹術的強烈影響，記載了347種藥物。其中有三種藥物:“上品”無毒，“中品”需要考慮，“下品”毒性大，不能長期服用。把朱砂歸類為無毒是錯誤的，但也發現它可以變成水銀，而且已經認識到加熱可以把硫化汞挖掘出來。
魏晉:提到了壹種“九轉沈丹”。以紅鹽(含氧化汞)、根雪(氯化汞和氯化亞汞)、白萱(醋酸鉛)為原料，經過反復提煉，得到“還丹”(成分可能是氧化汞)。[25]黃白還公布了他收集的壹些黃柏主方，強調制造金銀是延年益壽的手段，而不是致富的手段。同時也提到了鐵和硫酸銅的取代反應