1，大蒜葉枯病
大蒜葉枯病表現為葉尖黃色，條痕貫穿全葉，沿葉中脈發展或位於葉的壹側，病斑膨大後變為灰黃色或灰褐色。空氣濕度大時，病斑表面密被黑褐色黴菌覆蓋。病毒病的特點是葉片有明顯的花葉，有時褪綠或有黃色條紋，葉片扭曲，葉尖黃化等。
防治方法:加強栽培管理，培育健壯植株，增強抗病能力。加強田間排水，降低田間濕度，控制病情，田間作業時避免損傷葉片，減少傷口，避免田間人為傳播病害。
發病初期噴施500-1000倍的20%病毒A2可濕性粉劑或1000倍的1.5%植保乳油，預防病毒病。選擇50%速克靈可濕性粉劑800-1000倍或50%撲爾敏可濕性粉劑800倍和70%代森錳鋅可濕性粉劑500倍防治大蒜葉枯病。
2.細菌性軟腐病
大蒜侵染後，從葉緣或中脈開始，沿葉緣或中脈形成黃白色條紋，可貫穿全葉。濕度大時，患部黃褐色，軟腐。壹般是腳葉先發病，然後逐漸擴展到上部葉，導致整株枯萎或死亡。
防治方法:發病時可噴灑惡黴靈、銅絡合胺、枯草芽孢桿菌。
3.大蒜菌核病
患病部位位於大蒜假莖基部的薄膜下。起初病斑漬水，隨後變黑變灰，潰瘍腐爛，腐爛部分散發出濃烈的蒜味。大蒜葉鞘腐爛後，上部葉片萎蔫，逐漸變黃死亡，大蒜的根和根腐爛散開。
防治方法:發病後可噴灑黴酚酸酯、異菌脲、嘧菌環胺、啶酰菌胺等殺菌劑進行防治。
4.疫黴根腐病
這種病菌主要危害大蒜的根和鱗莖。發病初期，根部逐漸變褐腐爛，剖開鱗莖後，靠近根盤的鱗莖變褐。感病植株葉片自下而上逐漸變黃，幹枯死亡，植株明顯矮化，蒜薹短或不抽薹，嚴重感病植株不能形成產量或死亡。
防治方法:發病後，可用絡合銅、枯草芽孢桿菌、惡黴靈等噴桿防治。
5.洋蔥蒼蠅
幼蟲蠕蟲吃大蒜鱗莖，導致腐爛，黃葉，枯萎，甚至成片死亡。
防治方法:主要通過播前土壤處理、藥劑拌種、發生初期噴施等。有效藥劑為辛硫磷和毒死蜱。