經典部為綠色，歷史部為紅色，次部為藍色，收藏部為灰色。
據記載，封面的創意是由主編陸構思的。
在整本書抄寫結束時，他向甘龍建議，四庫全書有許多卷，如果用不同顏色的封面裝訂起來，閱讀這四種書可能會更方便。
終於聽從了陸的建議，決定用象征四季的顏色來表示類別。
經典在群首，就像新年的開始，要標上綠色；
歷史系的作品很豐富，比如夏天的熱情，紅色的運用；
部拾百家之學，猶如秋收，白宜；
手稿的收藏就像冬天的收藏，適合黑色。
文歲閣的《四庫全書》所用的顏色不是乾隆的“綠、紅、白、黑”，而是“綠、紅、藍、灰”，原因不明。
杭州溫嵐館出版的《四庫全書》封面為“綠、紅、白、黑”，與乾隆的決定壹致。
書的封面采用“四部:經、史、書、集，按春夏秋冬四種顏色”的裝幀方式，即以象征四季的顏色來表示書籍的類別:經在群首，猶如新年的開始，標以綠色；歷史系寫的很多，比如烈火熊熊，用的是紅色；子部集百家之學，猶如秋收，淺色(藍色)；詩詞歌賦系列像是冬季系列，適合深色(灰黑色)的顏色。按顏色劃分，壹目了然。