第壹圖書館位於西南大學北校區。這座建築分為新舊兩部分。老圖書館,建於1965,主要提供圖書館借閱服務、師範生免費閱讀和電子閱覽室服務。出了老圖書館,有兩排報紙欄,壹邊是圖書館報告廳,提供視聽放映服務,球類比賽,外國原版電影。旁邊是邵逸夫樓,是香港邵逸夫邵逸夫爵士1989捐贈的,主要提供圖書館的閱讀服務。
第二館位於西南大學南校區,西南大學生物技術學院旁邊。
第三個圖書館是西南大學榮昌校區圖書館,前身是四川畜牧獸醫學院圖書館,創建於1960。幾經合並,更名為西南大學榮昌校區圖書館。現有圖書館占地4370平方米,館藏紙質文獻30萬冊,涵蓋自然科學、社會科學等學科,重點是在校內設置的農業、生物、醫學等學科相關書籍。還有69個中外數據庫,包括維普中文科技期刊數據庫、中國科技期刊引文數據庫、學者電子書數據庫、方正阿帕比電子書數據庫、超星電子書數據庫等,包含約406萬篇數字文獻。