2009年，豬流感爆發。通過疾控中心的聯合研究，連花清瘟膠囊對H1N1也有壹定的作用。而且與其他類似功效的藥物相比，連花清瘟膠囊的價格更加親民，所以當年銷量大幅增長。
此後幾年，雖然連花清瘟多次被國家列為治療流行性感冒的推薦用藥，但銷量並沒有如懸崖般增長。直到2020年疫情爆發，第四版《新冠肺炎肺炎診療方案》才再次提出以蓮蓬清瘟之藥，對病毒有明顯療效，菜讓蓮蓬清瘟重回大眾視野。受疫情影響，連花清瘟唯壹生產企業以嶺藥業也在三年內實現了43元12元的股價漲幅。目前，蓮花清紋也已在中國大陸以外推廣。但由於成分和政策上的問題，連花清瘟膠囊在國外很多國家都沒有獲準入境，也沒有作為藥品在市場上銷售。
但無論如何，連花清瘟膠囊從研發至今，對很多病毒都有明顯的防治作用，這是有目共睹的，這也是它為什麽能成為？民族醫藥？主要原因之壹。
就目前的實驗和研究來看，連花清瘟對新冠肺炎的預防有壹定的作用，希望未來能盡快開發出抗病毒藥物。